More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3023 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3023  biotin/lipoyl attachment  100 
 
 
135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0035  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  47.06 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.869876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3082  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  47.06 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1591  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  45.71 
 
 
131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000447917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0319  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.27 
 
 
131 aa  103  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0337  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  45.52 
 
 
147 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0997  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  39.1 
 
 
131 aa  84.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1250  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.78 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0210  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  32.33 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1631  acetyl/propionyl-CoA carboxylase subunit alpha  48.53 
 
 
654 aa  67.4  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2153  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  45.12 
 
 
643 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  32.85 
 
 
633 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0799  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  30.37 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  44.16 
 
 
1204 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0583  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  30 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  30.53 
 
 
596 aa  63.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1199  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP binding domain protein  38.61 
 
 
637 aa  63.5  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000920632 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0212  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  32.84 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  30 
 
 
592 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  38.35 
 
 
590 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  38.35 
 
 
590 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  38.35 
 
 
590 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  31.3 
 
 
595 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3265  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding protein  45.45 
 
 
702 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  33.33 
 
 
598 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  32.31 
 
 
611 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  40.86 
 
 
599 aa  60.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1454  oxaloacetate decarboxylase  47.69 
 
 
690 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1433  biotin carboxyl carrier protein  34.35 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  31.54 
 
 
611 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1365  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  29.77 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0208474  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  39.29 
 
 
1228 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0916  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.85 
 
 
610 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1740  hypothetical protein  34.09 
 
 
596 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.407057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  37.8 
 
 
605 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  43.33 
 
 
1147 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1976  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  46.27 
 
 
652 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000860276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002525  oxaloacetate decarboxylase alpha chain  32.82 
 
 
594 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.450431  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  39.06 
 
 
1157 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  43.28 
 
 
656 aa  58.5  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2028  pyruvate carboxylase  43.08 
 
 
1146 aa  58.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  30.77 
 
 
602 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  43.08 
 
 
1231 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05850  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  47.69 
 
 
591 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  41.27 
 
 
594 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  33.58 
 
 
609 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2777  carbamoyl-phosphate synthase L chain/biotin carboxylase  41.18 
 
 
668 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.700495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2932  carbamoyl-phosphate synthase L chain/biotin carboxylase  41.18 
 
 
670 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0139  pyruvate carboxylase subunit B  40.32 
 
 
616 aa  57.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0177448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  47.14 
 
 
690 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1556  pyruvate carboxylase subunit B  45.9 
 
 
615 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.944098  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  40.7 
 
 
601 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  31.58 
 
 
597 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3376  oxaloacetate decarboxylase  38.1 
 
 
604 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709986  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2390  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  47.22 
 
 
168 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0158727  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  40 
 
 
1147 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  34.48 
 
 
569 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0962  biotin carboxylase  46.88 
 
 
661 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1070  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  46.88 
 
 
661 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1336  pyruvate carboxylase  41.94 
 
 
1148 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.441133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3163  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  30.08 
 
 
669 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0089  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  46.15 
 
 
666 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  44.62 
 
 
654 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3000  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  30.08 
 
 
669 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0816  pyruvate carboxylase  40.3 
 
 
1148 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000167673  hitchhiker  0.00000000644662 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03491  oxaloacetate decarboxylase  43.75 
 
 
593 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1528  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  41.46 
 
 
734 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.890646  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0402  pyruvate carboxylase  41.54 
 
 
1147 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1306  oxaloacetate decarboxylase  45.16 
 
 
596 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3665  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  43.75 
 
 
650 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243321  hitchhiker  0.000000000183935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2030  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  43.08 
 
 
644 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0317693  normal  0.435789 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2649  pyruvate carboxylase  40.98 
 
 
1148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00733169  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0137  pyruvate carboxylase subunit B  46.03 
 
 
577 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  34.35 
 
 
589 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  32.58 
 
 
599 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3483  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  40 
 
 
662 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2549  pyruvate carboxylase  40.32 
 
 
1149 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.011252  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  45.16 
 
 
568 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1819  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.04 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  33.33 
 
 
569 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1360  pyruvate carboxylase  40 
 
 
1147 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0615601 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  32.65 
 
 
604 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4067  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase, putative  43.75 
 
 
650 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  unclonable  0.000000957509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4048  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  41.79 
 
 
700 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1031  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  43.08 
 
 
602 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  42.19 
 
 
589 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1152  carbamoyl-phosphate synthase L subunit  41.18 
 
 
953 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  41.54 
 
 
1210 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3773  pyruvate carboxylase  40.98 
 
 
1148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.333  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  34.88 
 
 
589 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  34.35 
 
 
589 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0203  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.59 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0192452  normal  0.752214 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  34.35 
 
 
589 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  45.16 
 
 
569 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3650  oxaloacetate decarboxylase  42.19 
 
 
594 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4144  pyruvate carboxylase  38.46 
 
 
1144 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  43.55 
 
 
591 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3189  pyruvate carboxylase subunit B  43.94 
 
 
577 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1325  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  38.82 
 
 
602 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727992  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0831  oxaloacetate decarboxylase  42.19 
 
 
591 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>