More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0667 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0667  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
536 aa  1104    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  42.11 
 
 
525 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0293  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 
533 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  42.03 
 
 
522 aa  320  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  40.6 
 
 
516 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 
521 aa  312  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 
584 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 
517 aa  310  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4024  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 
530 aa  310  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2110  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 
549 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333319  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.9 
 
 
514 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.4 
 
 
561 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 
583 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.4 
 
 
582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 
563 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.58 
 
 
563 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.58 
 
 
582 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.21 
 
 
561 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.58 
 
 
563 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.58 
 
 
563 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  35.3 
 
 
551 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 
561 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 
573 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4250  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 
542 aa  301  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 
512 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 
564 aa  299  7e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 
539 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
543 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 
569 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0253  putative Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  40.9 
 
 
519 aa  297  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.03 
 
 
561 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.67 
 
 
561 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 
557 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 
566 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 
549 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.15 
 
 
585 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 
554 aa  291  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1859  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 
535 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.41558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 
584 aa  289  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.51 
 
 
512 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1879  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
535 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1925  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
535 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0636684  normal  0.805492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0992  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 
535 aa  286  8e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 
561 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 
508 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 
585 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 
662 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
549 aa  280  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4115  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 
517 aa  280  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 
559 aa  279  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 
490 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.67 
 
 
513 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 
498 aa  276  8e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
520 aa  274  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05990  phenylacetyl-CoA ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10160)  34.69 
 
 
562 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.255662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 
544 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.79 
 
 
510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9896  coumaryl-coa ligase  35.82 
 
 
523 aa  271  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.79 
 
 
510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.79 
 
 
510 aa  270  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.59 
 
 
510 aa  270  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.75 
 
 
510 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.59 
 
 
510 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.59 
 
 
510 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.59 
 
 
510 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 
521 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 
510 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 
564 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3231  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 
534 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000448213  normal  0.730696 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.79 
 
 
510 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 
501 aa  266  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.51 
 
 
532 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 
518 aa  266  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 
510 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
519 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3139  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 
534 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000126557  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  36.31 
 
 
515 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 
534 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 
495 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 
492 aa  263  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 
536 aa  263  8.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0967  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 
525 aa  262  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 
577 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 
516 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 
511 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
506 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.67 
 
 
572 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 
561 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 
565 aa  260  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 
499 aa  259  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  33.6 
 
 
510 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
583 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 
578 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
522 aa  258  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.1 
 
 
568 aa  257  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  34.26 
 
 
604 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
599 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.26 
 
 
503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.87 
 
 
583 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>