147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0078 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  100 
 
 
160 aa  322  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  90.62 
 
 
160 aa  294  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  90 
 
 
162 aa  294  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  90.51 
 
 
160 aa  290  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  90.51 
 
 
160 aa  290  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  89.94 
 
 
160 aa  288  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  89.24 
 
 
163 aa  287  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  88.12 
 
 
163 aa  286  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  85.62 
 
 
162 aa  282  1e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  86.88 
 
 
160 aa  280  6e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  85.62 
 
 
160 aa  280  6e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  85 
 
 
162 aa  280  7e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  84.38 
 
 
162 aa  279  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  86.16 
 
 
160 aa  276  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  85.62 
 
 
160 aa  276  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  83.75 
 
 
162 aa  276  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  83.75 
 
 
162 aa  276  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  83.75 
 
 
162 aa  276  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  82.5 
 
 
162 aa  272  1e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  85 
 
 
160 aa  270  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  82.5 
 
 
160 aa  270  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  83.12 
 
 
160 aa  266  9e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  82.5 
 
 
160 aa  266  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  79.38 
 
 
160 aa  261  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  80.62 
 
 
161 aa  260  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  81.01 
 
 
161 aa  260  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  81.01 
 
 
161 aa  260  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  78.75 
 
 
160 aa  255  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8145  transcriptional regulator, CarD family  87.5 
 
 
160 aa  256  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  78.75 
 
 
160 aa  255  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  78.75 
 
 
160 aa  255  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  80.75 
 
 
161 aa  255  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  77.22 
 
 
161 aa  247  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  77.22 
 
 
160 aa  246  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0663  transcriptional regulator, CarD family  83.12 
 
 
160 aa  245  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471723  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  69.38 
 
 
162 aa  238  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  57.14 
 
 
197 aa  175  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  51.92 
 
 
158 aa  172  2e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.61905e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0598  CarD-like protein  55.28 
 
 
198 aa  169  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.80876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  48.72 
 
 
176 aa  165  3e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  49.36 
 
 
158 aa  163  7e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  48.08 
 
 
158 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.16082e-07  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  53.46 
 
 
159 aa  161  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  45.86 
 
 
158 aa  158  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  45.51 
 
 
159 aa  157  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  44.87 
 
 
161 aa  152  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  42.04 
 
 
158 aa  151  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  50.97 
 
 
159 aa  145  2e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  46.26 
 
 
158 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.62697e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  42.5 
 
 
171 aa  134  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  38.22 
 
 
159 aa  132  2e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  38.22 
 
 
159 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  35.67 
 
 
164 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  35.67 
 
 
164 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  35.67 
 
 
164 aa  124  8e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  35.67 
 
 
164 aa  124  8e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  35.67 
 
 
164 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 
161 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  34.44 
 
 
158 aa  117  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  32.89 
 
 
153 aa  114  4e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  33.75 
 
 
171 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  34.44 
 
 
158 aa  114  8e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0409  transcriptional regulator, CarD family  36.94 
 
 
164 aa  113  8e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  33.12 
 
 
171 aa  113  1e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  33.12 
 
 
171 aa  113  1e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  33.55 
 
 
158 aa  112  1e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  36.31 
 
 
164 aa  113  1e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  37.27 
 
 
168 aa  113  1e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  6.22315e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  33.12 
 
 
171 aa  113  1e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  37.5 
 
 
162 aa  112  2e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  33.77 
 
 
158 aa  112  2e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  31.85 
 
 
159 aa  112  2e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  5.63805e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4546  CarD family transcriptional regulator  36.54 
 
 
159 aa  111  4e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  32.89 
 
 
158 aa  110  7e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  32.89 
 
 
158 aa  110  7e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  32.89 
 
 
158 aa  110  7e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  32.89 
 
 
158 aa  110  7e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  32.89 
 
 
158 aa  110  8e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  32.89 
 
 
158 aa  110  8e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4611  CarD family transcriptional regulator  36.84 
 
 
153 aa  110  8e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4967  CarD family transcriptional regulator  36.84 
 
 
148 aa  110  1e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0352786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  31.79 
 
 
158 aa  108  4e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  32.24 
 
 
153 aa  107  8e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  32.43 
 
 
188 aa  107  8e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  9.11518e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  36.08 
 
 
186 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2124  transcriptional regulator, CarD family  35.22 
 
 
161 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3244  CarD family transcriptional regulator  35.03 
 
 
155 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0842  transcriptional regulator, CarD family  33.96 
 
 
174 aa  94  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  5.02927e-07  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0247  CarD family transcriptional regulator  34.59 
 
 
175 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.246568 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0786  transcriptional regulator  34.81 
 
 
170 aa  90.5  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000100342  normal  0.0526342 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  32.92 
 
 
171 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1516  transcriptional regulator, CarD family  30.77 
 
 
191 aa  89  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1089  CarD family transcriptional regulator  34.81 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0349811  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1557  CarD family transcriptional regulator  34.81 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2425  CarD family transcriptional regulator  34.81 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  2.59686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0576  CarD family transcriptional regulator  33.12 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  5.04519e-11  unclonable  2.18406e-08 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0676  transcriptional regulator, CarD family  36.84 
 
 
176 aa  88.6  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  2.6469e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  33.74 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3537  CarD family transcriptional regulator  35.26 
 
 
172 aa  87.8  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2129  CarD family transcriptional regulator  32.68 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  4.17327e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>