More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2009 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
411 aa  813    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  69.95 
 
 
430 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  59.71 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  59.23 
 
 
416 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  53.63 
 
 
424 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  59.1 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.03 
 
 
412 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.03 
 
 
451 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  50.64 
 
 
413 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.03 
 
 
412 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.03 
 
 
412 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.03 
 
 
412 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.03 
 
 
412 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  53.38 
 
 
411 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  51.53 
 
 
425 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  53.38 
 
 
412 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.38 
 
 
412 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.38 
 
 
412 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.5 
 
 
412 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.38 
 
 
413 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.13 
 
 
413 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  52.88 
 
 
411 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  52.88 
 
 
413 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.37 
 
 
413 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  51.6 
 
 
440 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  52.85 
 
 
440 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  51.38 
 
 
414 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  54.55 
 
 
412 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  59.14 
 
 
418 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  54.03 
 
 
412 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  48.92 
 
 
414 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.91 
 
 
407 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.77 
 
 
399 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.43 
 
 
410 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  51.39 
 
 
405 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  48.22 
 
 
426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  49.75 
 
 
406 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  50.63 
 
 
405 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.37 
 
 
417 aa  354  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.52 
 
 
393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.74 
 
 
393 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  51.3 
 
 
401 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.38 
 
 
403 aa  349  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.28 
 
 
393 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  51.36 
 
 
411 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  51.36 
 
 
411 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  50 
 
 
397 aa  345  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.78 
 
 
401 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.13 
 
 
413 aa  345  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  46.68 
 
 
420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  48.97 
 
 
402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  50.49 
 
 
420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  45.81 
 
 
415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.19 
 
 
416 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.1 
 
 
415 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  47.95 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.89 
 
 
393 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.02 
 
 
429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  44.03 
 
 
422 aa  325  8.000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.67 
 
 
434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  48.21 
 
 
433 aa  315  8e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  48.12 
 
 
419 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.77 
 
 
419 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  46.52 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  47.95 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.81 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.36 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.51 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  47.85 
 
 
413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.55 
 
 
404 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.27 
 
 
400 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.27 
 
 
404 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 
404 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 
400 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 
404 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.86 
 
 
418 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  44.55 
 
 
326 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.48 
 
 
392 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.1 
 
 
410 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.64 
 
 
412 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  41.67 
 
 
395 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.56 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.33 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.26 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  43.4 
 
 
403 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  44.72 
 
 
398 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.72 
 
 
398 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.22 
 
 
398 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.84 
 
 
415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.6 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  39.6 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.6 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.06 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.84 
 
 
405 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3110  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  36.01 
 
 
375 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  36.72 
 
 
405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.72 
 
 
405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  36.05 
 
 
405 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1377  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.4 
 
 
409 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0469267  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.41 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>