197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0078 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  272  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  85.98 
 
 		 117 aa  204  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  84.55 
 
 		 116 aa  204  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  83.18 
 
 		 115 aa  197  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  83.18 
 
 		 115 aa  197  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  81.31 
 
 		 118 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  69.52 
 
 		 107 aa  173  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  49.51 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  40.78 
 
 		 114 aa  93.6  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  40.2 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  39.05 
 
 		 217 aa  84.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  33.94 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  35.64 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  34.65 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  36.45 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  32.04 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  38.38 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  29.81 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  37.25 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  33.33 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  34.31 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1539  hypothetical protein  31.91 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  30.7 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  34.31 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  27.41 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  39.32 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  27.41 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  28.16 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12171  ferredoxin  34.31 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.745288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  41.58 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  33.33 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  31.82 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  41.58 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 		 614 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  34.65 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  39.05 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  40.59 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  35.35 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.98 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  31.3 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36.36 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.33 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  32.32 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  37.62 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  39.22 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  36.46 
 
 		 596 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.37 
 
 		 677 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  39.81 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  34 
 
 		 596 aa  67.4  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.96 
 
 		 273 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  39 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  39 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  34.29 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  36.36 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 		 597 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32.38 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  34.34 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  34.34 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  34.34 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  33.33 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  32 
 
 		 595 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  34.65 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  36.63 
 
 		 603 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2241  hypothetical protein  33 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  35.05 
 
 		 602 aa  63.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  36.63 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  36.63 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  36.63 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  33.66 
 
 		 596 aa  63.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  34.69 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  34.65 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  34.65 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2933  hypothetical protein  35.34 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350772  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  37.5 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.78 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  29.13 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  35.64 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  36.63 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  40.78 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  32.04 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  35.64 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  31.58 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  35.64 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  35.64 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  34.31 
 
 		 597 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  35.64 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  35.64 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  30.61 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  27.08 
 
 		 614 aa  60.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  34 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  30.53 
 
 		 226 aa  60.1  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0333  ferredoxin, 2Fe-2S  37.18 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  34.65 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 		 572 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4568  hypothetical protein  32.99 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.01 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 		 610 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  32.32 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  32.67 
 
 		 597 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  32.58 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>