More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0397 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  297  3e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  54.36 
 
 
148 aa  161  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  56.76 
 
 
147 aa  156  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  52.03 
 
 
147 aa  156  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  51.01 
 
 
147 aa  153  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 
179 aa  137  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  49.32 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 
151 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 
151 aa  124  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 
151 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 
151 aa  121  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  41.89 
 
 
159 aa  120  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  45.64 
 
 
175 aa  120  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  118  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  40.43 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  40.94 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  46.62 
 
 
148 aa  115  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  45.27 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
148 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
151 aa  114  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  41.84 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  38.78 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  41.78 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  40.43 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  37.58 
 
 
149 aa  110  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  40.69 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  43.26 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  37.96 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  36.11 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  36.3 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
148 aa  106  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
149 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
149 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
147 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
147 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
147 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  38.62 
 
 
178 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
149 aa  104  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 
167 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  35.37 
 
 
148 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  40.14 
 
 
149 aa  104  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 
148 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  38.97 
 
 
191 aa  103  8e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
148 aa  103  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  39.46 
 
 
170 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
149 aa  102  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  35.86 
 
 
193 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  32.19 
 
 
150 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
148 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 
149 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 
189 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
148 aa  100  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  40.44 
 
 
149 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
146 aa  100  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 
189 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  37.84 
 
 
150 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  34.9 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  36.5 
 
 
148 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  31.03 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
188 aa  98.6  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  37.23 
 
 
189 aa  97.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  34.72 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  37.23 
 
 
189 aa  97.1  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  39.31 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
189 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
189 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
190 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  35.86 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  36.57 
 
 
189 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  34.31 
 
 
167 aa  95.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
189 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  33.79 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  35.62 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  36.57 
 
 
189 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  35.17 
 
 
186 aa  94  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  33.56 
 
 
157 aa  94  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 
204 aa  94  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
209 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  35.86 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 
194 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>