More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1840 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
451 aa  904    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  49.13 
 
 
454 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  44.81 
 
 
443 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  41.03 
 
 
444 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  41.03 
 
 
444 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  41.03 
 
 
444 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  41.03 
 
 
444 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  41.03 
 
 
444 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  40.79 
 
 
444 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  40.79 
 
 
444 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  40.79 
 
 
444 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  40.42 
 
 
443 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  40.79 
 
 
444 aa  353  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  40.28 
 
 
444 aa  348  8e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  39.21 
 
 
448 aa  326  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  39.21 
 
 
448 aa  326  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  43.51 
 
 
436 aa  320  5e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  39.82 
 
 
464 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 
443 aa  312  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  36.62 
 
 
458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  39.11 
 
 
438 aa  302  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  38.57 
 
 
448 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  39.34 
 
 
434 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  39.39 
 
 
443 aa  299  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.68 
 
 
434 aa  296  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  41 
 
 
434 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 
434 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  38.68 
 
 
434 aa  292  7e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  40.85 
 
 
446 aa  292  7e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  37.97 
 
 
464 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  38.39 
 
 
434 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 
441 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  38.86 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 
441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 
421 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.95 
 
 
461 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  41.54 
 
 
422 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  38.82 
 
 
440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  35.21 
 
 
440 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  35.24 
 
 
426 aa  259  7e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  37.71 
 
 
458 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  37.59 
 
 
443 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  35.17 
 
 
442 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  35.03 
 
 
442 aa  255  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  34.99 
 
 
418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  35.46 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  39.29 
 
 
446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  40.35 
 
 
398 aa  253  5.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  38.77 
 
 
446 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  38.68 
 
 
446 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  37.53 
 
 
429 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.99 
 
 
423 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  38.52 
 
 
422 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  35.82 
 
 
422 aa  250  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  35.04 
 
 
420 aa  250  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 
426 aa  250  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 
426 aa  250  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  38.27 
 
 
422 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  35.47 
 
 
425 aa  249  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  36.76 
 
 
446 aa  249  8e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  34.83 
 
 
419 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  35.88 
 
 
428 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.87 
 
 
429 aa  247  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  36.38 
 
 
428 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 
416 aa  247  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 
450 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  36.38 
 
 
428 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  37.81 
 
 
432 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  36.21 
 
 
423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  37.18 
 
 
427 aa  246  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  33.96 
 
 
418 aa  245  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1426  glutamyl-tRNA reductase  34.78 
 
 
425 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  35.31 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  35.03 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 
418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  36.38 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1795  glutamyl-tRNA reductase  34.55 
 
 
425 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  36.71 
 
 
428 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  37.26 
 
 
432 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  37.26 
 
 
432 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  37.26 
 
 
432 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  37.26 
 
 
432 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  37.26 
 
 
432 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  37.26 
 
 
432 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  38.66 
 
 
414 aa  242  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 
419 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  32.84 
 
 
434 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  36.71 
 
 
428 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 
425 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  35.85 
 
 
418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  36.4 
 
 
453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  37.22 
 
 
425 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  35.19 
 
 
431 aa  240  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  37.22 
 
 
425 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 
426 aa  239  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  36.44 
 
 
432 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  36.44 
 
 
432 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  36.77 
 
 
443 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  36.44 
 
 
434 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>