More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0367 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  100 
 
 
247 aa  516  1e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  100 
 
 
247 aa  516  1e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.48652e-08  unclonable  3.01239e-11 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  70.17 
 
 
248 aa  364  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  68.57 
 
 
248 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  68.75 
 
 
251 aa  362  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  68.51 
 
 
248 aa  360  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  66.94 
 
 
243 aa  355  4e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  66.94 
 
 
243 aa  355  4e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  66.94 
 
 
243 aa  355  4e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  67.36 
 
 
247 aa  353  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  66.53 
 
 
259 aa  353  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  65.29 
 
 
243 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  64.88 
 
 
243 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  65.43 
 
 
247 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  64.88 
 
 
243 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  66.67 
 
 
245 aa  348  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  65.57 
 
 
243 aa  347  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  63.64 
 
 
242 aa  345  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  62.81 
 
 
242 aa  340  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  63.6 
 
 
238 aa  340  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  63.37 
 
 
246 aa  335  5e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  62.4 
 
 
243 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  61.57 
 
 
242 aa  333  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  62.81 
 
 
242 aa  331  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  61.16 
 
 
243 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  61.48 
 
 
249 aa  328  4e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  61.16 
 
 
243 aa  327  1e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  62.81 
 
 
245 aa  325  3e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  60.25 
 
 
249 aa  324  7e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  61.76 
 
 
247 aa  317  9e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  61.68 
 
 
176 aa  211  9e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  59.52 
 
 
174 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  59.28 
 
 
190 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  56.47 
 
 
190 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  57.65 
 
 
175 aa  200  2e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  56.8 
 
 
190 aa  197  1e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  52.49 
 
 
189 aa  197  2e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.31 
 
 
175 aa  195  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  55.69 
 
 
189 aa  192  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  49.1 
 
 
179 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  46.47 
 
 
179 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  48.5 
 
 
175 aa  166  3e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  48.63 
 
 
233 aa  166  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  45.88 
 
 
181 aa  163  2e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  47.09 
 
 
182 aa  163  2e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  47.09 
 
 
182 aa  163  2e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  45.56 
 
 
179 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  45.71 
 
 
188 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  45 
 
 
184 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  46.2 
 
 
159 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  44.03 
 
 
162 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.68 
 
 
167 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  44.94 
 
 
160 aa  142  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  44.52 
 
 
160 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  45.86 
 
 
157 aa  141  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 
159 aa  139  5e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.93 
 
 
159 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  42.41 
 
 
162 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  49.63 
 
 
166 aa  134  1e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  40.51 
 
 
157 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  40.51 
 
 
157 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  40.51 
 
 
157 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  48.84 
 
 
168 aa  130  1e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.43004e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  41.29 
 
 
178 aa  131  1e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  39.24 
 
 
157 aa  131  1e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
168 aa  130  2e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  40.76 
 
 
160 aa  130  2e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.62 
 
 
158 aa  130  2e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  41.56 
 
 
157 aa  130  2e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.18 
 
 
157 aa  130  2e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  38.65 
 
 
160 aa  130  2e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  47.41 
 
 
166 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.4 
 
 
157 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  40.13 
 
 
160 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.13 
 
 
157 aa  129  4e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  42.59 
 
 
163 aa  129  4e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  43.67 
 
 
161 aa  129  5e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  41.14 
 
 
157 aa  129  5e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.9477e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  43.87 
 
 
161 aa  129  5e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  39.24 
 
 
157 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  40.88 
 
 
157 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  39.24 
 
 
157 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  39.24 
 
 
157 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  47.83 
 
 
166 aa  128  8e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.06 
 
 
168 aa  127  1e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  43.87 
 
 
161 aa  127  1e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  40.51 
 
 
157 aa  127  1e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3052  redoxin domain-containing protein  47.1 
 
 
166 aa  127  2e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  49.26 
 
 
168 aa  127  2e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  48.09 
 
 
168 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  47.73 
 
 
169 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  44.6 
 
 
168 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  42.58 
 
 
161 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  47.06 
 
 
192 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  45.65 
 
 
166 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.16 
 
 
168 aa  125  8e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  43.17 
 
 
168 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.45 
 
 
168 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.45 
 
 
168 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  45.45 
 
 
214 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>