78 genes were found for organism Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
PHATRDRAFT_17029  CDS  NC_011699  187010  187999  990  predicted protein  XP_002185497  normal  0.698302  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_17044  CDS  NC_011699  88450  89178  729  de-etiolated 2 like protein  XP_002185517  hitchhiker  0.00948556  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_17048  CDS  NC_011699  131548  131748  201  predicted protein  XP_002185525  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_17059  CDS  NC_011699  162084  162734  651  predicted protein  XP_002185534  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_1905  CDS  NC_011699  79481  80834  1354  predicted protein  XP_002185516  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_24161  CDS  NC_011699  6622  9234  2613  predicted protein  XP_002185507  normal  0.314931  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_24186  CDS  NC_011699  82249  86154  3906  predicted protein  XP_002185483  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_24195  CDS  NC_011699  96119  101909  5791  CPS III, carbamoyl-phosphate synthase mitochindrial precursor  XP_002185520  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_24223  CDS  NC_011699  193010  194280  1271  predicted protein  XP_002185541  normal  0.267509  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_31322  CDS  NC_011699  106216  108388  2173  predicted protein  XP_002185522  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_31339  CDS  NC_011699  181255  185403  4149  predicted protein  XP_002185538  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41501  CDS  NC_011699  9823  11264  1442  predicted protein  XP_002185470  normal  0.364066  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41504  CDS  NC_011699  14713  15168  456  predicted protein  XP_002185508  hitchhiker  0.000401457  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41506  CDS  NC_011699  23023  24381  1359  predicted protein  XP_002185473  decreased coverage  2.4093e-05  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41507  CDS  NC_011699  35120  38487  3368  predicted protein  XP_002185474  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41508  CDS  NC_011699  44140  45324  1185  predicted protein  XP_002185475  normal  0.328338  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41510  CDS  NC_011699  47182  47815  634  predicted protein  XP_002185476  normal  0.0150965  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41511  CDS  NC_011699  47977  48773  797  predicted protein  XP_002185510  normal  0.0285567  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41518  CDS  NC_011699  64289  64780  492  predicted protein  XP_002185479  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41522  CDS  NC_011699  73940  74488  549  predicted protein  XP_002185481  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41530  CDS  NC_011699  93889  94476  588  predicted protein  XP_002185519  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41531  CDS  NC_011699  95315  97000  1686  nad-dependent epimerase/dehydratase  XP_002185484  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41541  CDS  NC_011699  128060  128509  450  predicted protein  XP_002185524  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41545  CDS  NC_011699  135887  136336  450  predicted protein  XP_002185526  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41548  CDS  NC_011699  140453  141136  684  predicted protein  XP_002185491  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41555  CDS  NC_011699  155118  156262  1145  predicted protein  XP_002185493  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41559  CDS  NC_011699  162840  167263  4424  predicted protein  XP_002185494  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41562  CDS  NC_011699  175042  176607  1566  predicted protein  XP_002185495  normal  0.0981287  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41570  CDS  NC_011699  191712  193019  1308  precursor of desaturase omega-3 desaturase  XP_002185498  normal  0.692269  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41575  CDS  NC_011699  216544  217032  489  predicted protein  XP_002185499  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41576  CDS  NC_011699  223295  226602  3308  predicted protein  XP_002185500  normal  0.433336  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41577  CDS  NC_011699  230073  233380  3308  predicted protein  XP_002185501  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41578  CDS  NC_011699  235886  237280  1395  predicted protein  XP_002185502  normal  0.0705581  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41581  CDS  NC_011699  247658  251176  3519  predicted protein  XP_002185503  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_41582  CDS  NC_011699  253148  256719  3572  predicted protein  XP_002185504  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50525  CDS  NC_011699  1369  3736  2368  predicted protein  XP_002185505  normal  0.196683  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50527  CDS  NC_011699  4810  6472  1663  predicted protein  XP_002185469  normal  0.0147272  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50530  CDS  NC_011699  11534  12753  1220  predicted protein  XP_002185471  normal  0.327253  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50531  CDS  NC_011699  13039  14670  1632  predicted protein  XP_002185472  hitchhiker  0.00754159  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50535  CDS  NC_011699  45626  46912  1287  predicted protein  XP_002185509  normal  0.0910456  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50537  CDS  NC_011699  49394  54022  4629  predicted protein  XP_002185477  normal  0.437528  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50540  CDS  NC_011699  54794  58604  3811  translocator of the inner chloroplast envelope membrane 110k  XP_002185478  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50541  CDS  NC_011699  61637  63264  1628  predicted protein  XP_002185512  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50542  CDS  NC_011699  65602  67190  1589  predicted protein  XP_002185480  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50544  CDS  NC_011699  72313  73343  1031  predicted protein  XP_002185514  normal  0.965292  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50545  CDS  NC_011699  74640  75326  687  predicted protein  XP_002185515  normal  0.748479  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50546  CDS  NC_011699  76603  78910  2308  predicted protein  XP_002185482  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50551  CDS  NC_011699  89639  93175  3537  predicted protein  XP_002185518  normal  0.0179423  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50556  CDS  NC_011699  105287  106162  876  predicted protein  XP_002185485  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50558  CDS  NC_011699  108755  109904  1150  predicted protein  XP_002185486  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50559  CDS  NC_011699  110460  111769  1310  predicted protein  XP_002185523  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50561  CDS  NC_011699  128961  131228  2268  predicted protein  XP_002185488  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50562  CDS  NC_011699  132365  135484  3120  predicted protein  XP_002185489  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50564  CDS  NC_011699  138096  139862  1767  predicted protein  XP_002185490  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50567  CDS  NC_011699  144655  145823  1169  predicted protein  XP_002185528  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50569  CDS  NC_011699  150316  151617  1302  predicted protein  XP_002185530  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50570  CDS  NC_011699  151706  153994  2289  predicted protein  XP_002185531  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50571  CDS  NC_011699  156295  157646  1352  predicted protein  XP_002185532  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50572  CDS  NC_011699  158070  161111  3042  predicted protein  XP_002185533  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50575  CDS  NC_011699  167551  170054  2504  predicted protein  XP_002185535  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50576  CDS  NC_011699  173202  174595  1394  predicted protein  XP_002185536  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50577  CDS  NC_011699  176799  178585  1787  acetylornithine aminotransferase  XP_002185537  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50578  CDS  NC_011699  179032  180465  1434  predicted protein  XP_002185496  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50582  CDS  NC_011699  188474  189651  1178  predicted protein  XP_002185539  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50583  CDS  NC_011699  189828  191245  1418  predicted protein  XP_002185540  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50585  CDS  NC_011699  198075  199626  1552  predicted protein  XP_002185542  normal  0.353729  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50586  CDS  NC_011699  210608  211789  1182  predicted protein  XP_002185543  normal  0.616621  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50588  CDS  NC_011699  240266  242873  2608  predicted protein  XP_002185545  normal  0.106084  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_50589  CDS  NC_011699  244161  246311  2151  predicted protein  XP_002185546  decreased coverage  0.00629858  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_51291  CDS  NC_011699  4230  4673  444  predicted protein  XP_002185506  hitchhiker  0.00204375  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_51297  CDS  NC_011699  103525  104904  1380  predicted protein  XP_002185521  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_51298  CDS  NC_011699  141846  143166  1321  phosphoglycerate mutase  XP_002185492  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_52750  CDS  NC_011699  127320  127820  501  ubiquitin-protein ligase 1  XP_002185487  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_55215  CDS  NC_011699  67147  69767  2621  heat shock protein Hsp90  XP_002185513  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_56468  CDS  NC_011699  51225  54070  2846  plastidic enolase  XP_002185511  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_7774  CDS  NC_011699  146271  146570  300  predicted protein  XP_002185529  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_8024  CDS  NC_011699  143830  144165  336  predicted protein  XP_002185527  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATRDRAFT_8538  CDS  NC_011699  214531  214740  210  predicted protein  XP_002185544  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>