6542 genes were found for organism Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 66    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Snas_0001  CDS  NC_013947  64  1764  1701  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003508817  decreased coverage  1.50843e-05  normal  0.201816  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0002  CDS  NC_013947  2246  3388  1143  DNA polymerase III subunit beta  YP_003508818  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0003  CDS  NC_013947  3420  4298  879  6-phosphogluconate dehydrogenase decarboxylating  YP_003508819  normal  0.026286  normal  0.412611  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0004  CDS  NC_013947  4365  5501  1137  DNA replication and repair protein RecF  YP_003508820  normal  0.332828  normal  0.294433  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0005  CDS  NC_013947  5491  5895  405  hypothetical protein  YP_003508821  normal  0.918474  normal  0.25905  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0006  CDS  NC_013947  6164  8134  1971  DNA gyrase B subunit  YP_003508822  normal  normal  0.381905  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0007  CDS  NC_013947  8248  10743  2496  DNA gyrase A subunit  YP_003508823  normal  normal  0.386887  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0008  CDS  NC_013947  10749  11357  609  hypothetical protein  YP_003508824  normal  normal  0.252458  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0009  CDS  NC_013947  11687  12403  717  hypothetical protein  YP_003508825  normal  normal  0.394336  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0010  CDS  NC_013947  12407  12853  447  hypothetical protein  YP_003508826  normal  normal  0.370243  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0011  CDS  NC_013947  12924  14750  1827  ABC transporter related protein  YP_003508827  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0012  CDS  NC_013947  14936  17722  2787  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003508828  normal  0.111668  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0013  CDS  NC_013947  17859  18845  987  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  YP_003508829  normal  0.0388317  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0014  CDS  NC_013947  18872  19444  573  NADPH-dependent FMN reductase  YP_003508830  normal  0.242053  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0015  CDS  NC_013947  19648  21021  1374  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003508831  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0016    NC_013947  21038  21350  313      normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0017  CDS  NC_013947  21366  22034  669  transcriptional regulator, MerR family  YP_003508832  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0018  CDS  NC_013947  22138  23130  993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003508833  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0019  CDS  NC_013947  23187  24437  1251  beta-lactamase  YP_003508834  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0020  CDS  NC_013947  24604  25716  1113  ABC transporter related protein  YP_003508835  normal  0.925288  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0021  CDS  NC_013947  25785  26558  774  hypothetical protein  YP_003508836  normal  0.71791  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0022  CDS  NC_013947  26946  28607  1662  TrkA-N domain-containing protein  YP_003508837  normal  0.377987  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0023  CDS  NC_013947  28682  29839  1158  PKD repeat-containing protein  YP_003508838  normal  0.347453  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0024  CDS  NC_013947  29910  30440  531  hypothetical protein  YP_003508839  normal  0.808885  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0025  CDS  NC_013947  30455  31006  552  transcriptional regulator, XRE family  YP_003508840  normal  0.401315  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0026  CDS  NC_013947  31080  33551  2472  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_003508841  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0027  CDS  NC_013947  33595  35343  1749  FAD dependent oxidoreductase  YP_003508842  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0028  CDS  NC_013947  35568  36209  642  hypothetical protein  YP_003508843  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0029  CDS  NC_013947  36691  37593  903  hypothetical protein  YP_003508844  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0030  CDS  NC_013947  38185  38565  381  hypothetical protein  YP_003508845  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0031  CDS  NC_013947  38946  39869  924  DNA protecting protein DprA  YP_003508846  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0032  CDS  NC_013947  40179  42224  2046  hypothetical protein  YP_003508847  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0033  CDS  NC_013947  42427  43995  1569  hypothetical protein  YP_003508848  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0034  CDS  NC_013947  43979  44374  396  hypothetical protein  YP_003508849  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0035  CDS  NC_013947  44403  45365  963  hypothetical protein  YP_003508850  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0036  CDS  NC_013947  45355  45720  366  hypothetical protein  YP_003508851  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0037  CDS  NC_013947  45756  46277  522  hypothetical protein  YP_003508852  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0038  CDS  NC_013947  46412  47410  999  hypothetical protein  YP_003508853  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0039  CDS  NC_013947  47442  48047  606  transcriptional regulator, TetR family  YP_003508854  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0040  CDS  NC_013947  48074  48532  459  hypothetical protein  YP_003508855  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0041  CDS  NC_013947  48601  50070  1470  hypothetical protein  YP_003508856  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0042  CDS  NC_013947  50080  50436  357  hypothetical protein  YP_003508857  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0043  CDS  NC_013947  50433  50879  447  hypothetical protein  YP_003508858  normal  0.817144  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0044  CDS  NC_013947  51060  51950  891  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  YP_003508859  normal  0.688512  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0045  CDS  NC_013947  51944  53089  1146  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  YP_003508860  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0046  CDS  NC_013947  53090  53797  708  GntR domain-containing protein  YP_003508861  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0047  CDS  NC_013947  53814  54560  747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003508862  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0048  CDS  NC_013947  54675  55979  1305  extracellular solute-binding protein family 1  YP_003508863  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0049  CDS  NC_013947  55992  56885  894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003508864  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0050  CDS  NC_013947  56882  57718  837  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003508865  normal  0.66981  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0051  CDS  NC_013947  57727  59718  1992  Beta-galactosidase  YP_003508866  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0052  CDS  NC_013947  59744  60304  561  putative signal transduction protein with EFhand domain  YP_003508867  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0053  CDS  NC_013947  60375  61211  837  hypothetical protein  YP_003508868  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0054  CDS  NC_013947  61314  61547  234  hypothetical protein  YP_003508869  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0055  CDS  NC_013947  61544  62539  996  hypothetical protein  YP_003508870  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0056  CDS  NC_013947  62666  63208  543  hypothetical protein  YP_003508871  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0057  CDS  NC_013947  63235  63921  687  hypothetical protein  YP_003508872  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0058  CDS  NC_013947  63972  64622  651  transcriptional regulator, TetR family  YP_003508873  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0059  CDS  NC_013947  64712  65290  579  hypothetical protein  YP_003508874  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0060  CDS  NC_013947  65346  65903  558  cyclase/dehydrase  YP_003508875  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0061  CDS  NC_013947  66058  66840  783  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_003508876  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0062  CDS  NC_013947  66837  67070  234  hypothetical protein  YP_003508877  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0063  CDS  NC_013947  67067  67744  678  hypothetical protein  YP_003508878  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0064  CDS  NC_013947  68185  71487  3303  lysyl-tRNA synthetase  YP_003508879  normal  0.9544  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0065  CDS  NC_013947  71640  74444  2805  transcriptional regulator, SARP family  YP_003508880  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0066  CDS  NC_013947  74558  74989  432  hypothetical protein  YP_003508881  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0067  CDS  NC_013947  74998  76455  1458  hypothetical protein  YP_003508882  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0068  CDS  NC_013947  76446  76973  528  hypothetical protein  YP_003508883  normal  normal  0.90321  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0069  CDS  NC_013947  76952  77281  330  hypothetical protein  YP_003508884  normal  normal  0.649675  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0070  CDS  NC_013947  77299  78162  864  hypothetical protein  YP_003508885  normal  normal  0.18889  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0071  CDS  NC_013947  78289  80472  2184  hypothetical protein  YP_003508886  normal  normal  0.276247  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0072  CDS  NC_013947  80612  82501  1890  hypothetical protein  YP_003508887  normal  normal  0.504192  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0073  CDS  NC_013947  82524  82979  456  hypothetical protein  YP_003508888  normal  normal  0.260554  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0074  CDS  NC_013947  83017  83901  885  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003508889  normal  normal  0.290235  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0075  CDS  NC_013947  84067  85125  1059  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  YP_003508890  normal  normal  0.568113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0076  CDS  NC_013947  85184  85999  816  glycosyl transferase family 2  YP_003508891  normal  normal  0.737127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0077  CDS  NC_013947  85996  87753  1758  hypothetical protein  YP_003508892  normal  normal  0.325628  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0078  CDS  NC_013947  87756  88367  612  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003508893  normal  normal  0.484067  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0079  CDS  NC_013947  88357  89412  1056  hypothetical protein  YP_003508894  normal  normal  0.725596  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0080  CDS  NC_013947  89655  90515  861  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  YP_003508895  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0081  CDS  NC_013947  90523  91290  768  putative transcriptional acitvator, Baf family  YP_003508896  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0082  CDS  NC_013947  91294  92169  876  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  YP_003508897  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0083  CDS  NC_013947  92318  92557  240  hypothetical protein  YP_003508898  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0084  CDS  NC_013947  92554  93426  873  transcriptional regulator, XRE family  YP_003508899  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0085  CDS  NC_013947  93624  93803  180  hypothetical protein  YP_003508900  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0086    NC_013947  94011  94212  202      normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0087  CDS  NC_013947  94309  95958  1650  L-aspartate oxidase  YP_003508901  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0088  CDS  NC_013947  95958  97421  1464  peptidase S10 serine carboxypeptidase  YP_003508902  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0089  CDS  NC_013947  97433  97885  453  aspartate 1-decarboxylase  YP_003508903  normal  0.719828  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0090  CDS  NC_013947  97885  98706  822  pantoate/beta-alanine ligase  YP_003508904  normal  0.8293  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0091  CDS  NC_013947  98703  99629  927  putative cytoplasmic protein  YP_003508905  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0092  CDS  NC_013947  99782  100633  852  N-acetyltransferase  YP_003508906  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0093  CDS  NC_013947  100678  101448  771  Arylamine N-acetyltransferase  YP_003508907  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0094  CDS  NC_013947  101455  102390  936  hypothetical protein  YP_003508908  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0095  CDS  NC_013947  102444  103580  1137  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_003508909  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0096  CDS  NC_013947  103586  104146  561  transcriptional regulator, TetR family  YP_003508910  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0097  CDS  NC_013947  104136  105686  1551  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003508911  normal  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0098  CDS  NC_013947  105787  106587  801  hypothetical protein  YP_003508912  normal  0.912565  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0099  CDS  NC_013947  106589  107998  1410  imidazolonepropionase  YP_003508913  normal  normal  0.776305  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_0100  CDS  NC_013947  107995  109650  1656  urocanate hydratase  YP_003508914  normal  normal  0.431481  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 66    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>