17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0067 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0067  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  922    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3245  hypothetical protein  27.95 
 
 
388 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  normal  0.0166959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2681  hypothetical protein  27.23 
 
 
383 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0504792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5364  hypothetical protein  31.33 
 
 
525 aa  77.4  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5495  hypothetical protein  26.32 
 
 
538 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000357774  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3872  hypothetical protein  36.74 
 
 
555 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302386  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  27.27 
 
 
3471 aa  53.9  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  27.27 
 
 
3472 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  31.47 
 
 
268 aa  53.5  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4621  hypothetical protein  22.41 
 
 
580 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204992  hitchhiker  0.00361313 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.73 
 
 
1888 aa  51.6  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  26.4 
 
 
3521 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  25 
 
 
484 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  41.73 
 
 
522 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0472  hypothetical protein  25 
 
 
526 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.124332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  34.58 
 
 
830 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  30.6 
 
 
407 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>