124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Ser-2 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0009  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 88 bp  119  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0165  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 88 bp  119  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0016  tRNA-Ser  92.42 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0019  tRNA-Ser  92.42 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0016  tRNA-Ser  92.42 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0019  tRNA-Ser  92.42 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0021  tRNA-Ser  90.28 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.846979  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  97.3 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0822  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0051  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.7492  normal  0.229095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0038  tRNA-Ser  97.22 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna25  tRNA-Ser  97.22 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000226123  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna26  tRNA-Ser  97.22 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0061  tRNA-Ser  97.22 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0035  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181882  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0027  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0851644  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0027  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t40  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA47  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.276282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0091  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000323323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS01508  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0044  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0008  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0059  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.98639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0006  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0037  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.182504  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0033  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341382  normal  0.773631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00023  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0052  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000218477  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0026    94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0760613  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0040  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000505544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0064  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0010  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0026  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.580647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0041  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0042  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.760649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA21  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213698  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1206  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4663  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000383735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5026  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1162  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.520358 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0065  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0269499  hitchhiker  0.0000672663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2147  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.478396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0027  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1045  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.395551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2775  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0559618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0045  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1150  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.14508  normal  0.321314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0022  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1128  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.93394e-25 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1195  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6557  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0029  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578587  hitchhiker  0.00382784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0045  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.331692  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4245  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0073  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000673451  normal  0.952088 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1445  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299602  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0068  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.639898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0059  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0001  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0034  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152108  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0020  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0013  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0051  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0000142144  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  87.27 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t60  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R47  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483032  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1581  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151315  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0031  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0040  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0414  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0012  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30420  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0810  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0309716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2643  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2954  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3020  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.419002  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1969  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156913  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0030  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.993805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0046  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52557  normal  0.0292878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2605  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0055  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0709169  normal  0.617884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0074  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982484  normal  0.493947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0051  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.794594  normal  0.436423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>