198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0414 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0414  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0035  tRNA-Ser  89.55 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181882  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0027  tRNA-Ser  89.55 
 
 
88 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0851644  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0027  tRNA-Ser  89.55 
 
 
88 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0045  tRNA-Ser  94 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103835  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna26  tRNA-Ser  90.77 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0058  tRNA-Ser  87.06 
 
 
86 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.337917  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0064  tRNA-Ser  94 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna25  tRNA-Ser  90.77 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000226123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0061  tRNA-Ser  90.77 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0047  tRNA-Ser  95.45 
 
 
88 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer03  tRNA-Ser  95.45 
 
 
93 bp  71.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000286931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0049  tRNA-Ser  95.45 
 
 
88 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0043  tRNA-Ser  95.45 
 
 
88 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0038  tRNA-Ser  95.45 
 
 
88 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0058  tRNA-Ser  95.45 
 
 
88 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.345279  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0056  tRNA-Ser  95.45 
 
 
88 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000159077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2605  tRNA-Ser  89.33 
 
 
92 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60250  tRNA-Ser  89.33 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  87.36 
 
 
90 bp  69.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30420  tRNA-Ser  89.33 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0022  tRNA-Ser  97.37 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  97.37 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0026    97.37 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0760613  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  97.37 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  97.37 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0051  tRNA-Ser  86.49 
 
 
88 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA21  tRNA-Ser  97.37 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213698  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0021  tRNA-Ser  95 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.846979  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  93.18 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R47  tRNA-Ser  93.02 
 
 
88 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483032  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0005  tRNA-Ser  93.02 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.87296e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  93.02 
 
 
90 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0010  tRNA-Ser  86.57 
 
 
88 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0026  tRNA-Ser  86.57 
 
 
88 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.580647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0027  tRNA-Ser  86.57 
 
 
88 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896039  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0046  tRNA-Ser  86.57 
 
 
88 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52557  normal  0.0292878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  94.74 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.813738  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0038  tRNA-Ser  94.74 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0957945 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0016  tRNA-Ser  97.37 
 
 
91 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0019  tRNA-Ser  97.37 
 
 
91 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0016  tRNA-Ser  97.37 
 
 
91 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0019  tRNA-Ser  97.37 
 
 
91 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0001  tRNA-Ser  97.37 
 
 
91 bp  60  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0030  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.993805 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  94.74 
 
 
92 bp  60  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0051  tRNA-Ser  94.59 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.794594  normal  0.436423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t60  tRNA-Ser  94.59 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0085  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0040  tRNA-Ser  83.95 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000505544  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0062  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2408  normal  0.378741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0031  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0065  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0040  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0049  tRNA-Ser  94.59 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0012  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591659  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  96.97 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0074  tRNA-Ser  94.59 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982484  normal  0.493947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0020  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0294133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0029  tRNA-Ser  96.97 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578587  hitchhiker  0.00382784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0006  tRNA-Ser  94.59 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0029  tRNA-Ser  96.97 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0695798 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6557  tRNA-Ser  96.97 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0078  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309348  tRNA-Ser  83.53 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366383 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0038  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0006  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0071  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000718864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t032  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0070  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000322089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  94.44 
 
 
88 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0062  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00255663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0072  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140823  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0081  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147278  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4245  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1581  tRNA-Ser  94.44 
 
 
88 bp  56  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0073  tRNA-Ser  96.88 
 
 
88 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000673451  normal  0.952088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0080  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427026  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0081  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000367206  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0091  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00307776  normal  0.28235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0080  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000011536  normal  0.292608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0081  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000139666  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0099  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70942  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0059  tRNA-Ser  94.44 
 
 
88 bp  56  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0060  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0407433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0061  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00295875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2954  tRNA-Ser  94.44 
 
 
88 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3020  tRNA-Ser  94.44 
 
 
88 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.419002  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1969  tRNA-Ser  94.44 
 
 
88 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156913  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0040  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0094275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0041  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00826938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0060  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0080  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.247761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>