205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0822 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0822  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0006  tRNA-Ser  91.95 
 
 		 90 bp  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  91.57 
 
 		 90 bp  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0038  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  103  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0031  tRNA-Ser  90.79 
 
 		 90 bp  95.6  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0012  tRNA-Ser  90.79 
 
 		 90 bp  95.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0051  tRNA-Ser  90.79 
 
 		 90 bp  95.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.7492  normal  0.229095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0040  tRNA-Ser  89.16 
 
 		 90 bp  93.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0009  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0165  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0038  tRNA-Ser  90.28 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  87.36 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  87.95 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  87.95 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  87.95 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01508  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0044  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.182504  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341382  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0020  tRNA-Ser  88.16 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0294133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t40  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA47  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.276282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  86.75 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  86.75 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0062  tRNA-Ser  86.75 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2408  normal  0.378741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0065  tRNA-Ser  86.75 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0085  tRNA-Ser  86.75 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0021  tRNA-Ser  87.84 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.846979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0026    85.54 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0760613  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0078  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0022  tRNA-Ser  85.54 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA21  tRNA-Ser  85.54 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213698  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0006  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0059  tRNA-Ser  86.49 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.98639 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60250  tRNA-Ser  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  84.34 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0019  tRNA-Ser  84.34 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  84.34 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309077  tRNA-Ser  84.34 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309109  tRNA-Ser  84.34 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.701033  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309153  tRNA-Ser  84.34 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  84.34 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0007  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1188  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0037  tRNA-Ser  84.21 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12770  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t60  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R47  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483032  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0005  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.87296e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0074  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982484  normal  0.493947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0058  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.337917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0045  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0064  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30420  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0051  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.794594  normal  0.436423 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  83.13 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2605  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0046  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52557  normal  0.0292878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0049  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123385 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0039  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0068  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.639898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t16  tRNA-Ser  100 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  88 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0029  tRNA-Ser  84.29 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0695798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4245  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1445  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299602  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.743762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0027  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233684  normal  0.0829519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0008  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.32167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0073  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000673451  normal  0.952088 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0010  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0026  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0029  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.59905e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0051  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.44549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0055  tRNA-Ser  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0091  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000323323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0026  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0002  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000138039  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0056  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0468  tRNA-Ser  82.89 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0064  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0062  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_513  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0015  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0019  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282273 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0001  tRNA-Ser  85 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0016  tRNA-Ser  84.13 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>