36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2389 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  50.38 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  50.77 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  37.97 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  27.71 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  26.16 
 
 		 307 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  29.12 
 
 		 306 aa  92  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  25.75 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  27.71 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  24.79 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  29.48 
 
 		 300 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  24.35 
 
 		 307 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  27.67 
 
 		 294 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  26.2 
 
 		 298 aa  85.1  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  23.67 
 
 		 268 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  26.75 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  25.89 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  25.72 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  28.35 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  26.45 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  27.17 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  28.02 
 
 		 308 aa  78.6  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  29.07 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  26.32 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  27.78 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  27.78 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  28 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  27.67 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  27.27 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  26.47 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  27.21 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  24.91 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  27.76 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  25.69 
 
 		 288 aa  72  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  25.7 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  25.19 
 
 		 767 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>