36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1063 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  527  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  97.67 
 
 
258 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  50.77 
 
 
260 aa  281  9e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  24.79 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  28.69 
 
 
268 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  28.06 
 
 
307 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  28.17 
 
 
298 aa  89  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  27.53 
 
 
294 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  27.24 
 
 
307 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  29.39 
 
 
294 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  26.8 
 
 
303 aa  85.9  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  24.43 
 
 
282 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  26.39 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  28.52 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  25.68 
 
 
306 aa  82  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  26.59 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  27.69 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  27.16 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  25.1 
 
 
295 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  25.64 
 
 
307 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  25.84 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  27.53 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  23.39 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  25.28 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  27.5 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  27.31 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  24.91 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  27.31 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  27.2 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  24.9 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  24.15 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  27.5 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  23.55 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  24.36 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  27.96 
 
 
767 aa  48.9  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>