36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0645 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  554  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  39.68 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  37.97 
 
 
260 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  39.55 
 
 
305 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  38.46 
 
 
255 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  38.78 
 
 
294 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  35.29 
 
 
307 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  36.89 
 
 
294 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  35.16 
 
 
307 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  38.21 
 
 
304 aa  141  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  37.4 
 
 
304 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  38.21 
 
 
304 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  38.56 
 
 
295 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  37.04 
 
 
308 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  38 
 
 
305 aa  136  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  36.36 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  36.93 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  36.93 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  36.9 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  37.04 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  35.74 
 
 
297 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  33.82 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  32.91 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  36.18 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  34.75 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  35.17 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  32.97 
 
 
298 aa  125  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  36.89 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  37.05 
 
 
268 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  33.08 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  32.42 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  32.43 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  30.92 
 
 
303 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  32.64 
 
 
288 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  40.87 
 
 
767 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>