35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3708 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  64.31 
 
 		 298 aa  350  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  59.78 
 
 		 303 aa  305  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  60.65 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  60.14 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  48.39 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  48.79 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  48.56 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  49.07 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  49.8 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  49.05 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  48.67 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  49.4 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  49.39 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  50.19 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  50.2 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  47.97 
 
 		 310 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  48.83 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  49.19 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  49.19 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  47.83 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  49.19 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  48.61 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  48.03 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  45.05 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  48.59 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  49.19 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  46.01 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  47.56 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  31.39 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  32.64 
 
 		 274 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  29.18 
 
 		 255 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  25.69 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  23.65 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  24.36 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>