36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2856 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  74.01 
 
 		 304 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  74.05 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  73.36 
 
 		 304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  67.82 
 
 		 305 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  68.06 
 
 		 331 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  70.5 
 
 		 305 aa  362  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  70 
 
 		 303 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  70.07 
 
 		 310 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  70.11 
 
 		 302 aa  361  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  70.11 
 
 		 302 aa  361  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  70.18 
 
 		 312 aa  360  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  69.01 
 
 		 308 aa  356  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  67.47 
 
 		 300 aa  344  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  64.86 
 
 		 297 aa  343  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  60.9 
 
 		 294 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  60.53 
 
 		 294 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  53.61 
 
 		 307 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  53.06 
 
 		 307 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  53.76 
 
 		 307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  53.96 
 
 		 268 aa  255  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  49.1 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  49.39 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  49.81 
 
 		 268 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  48.38 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  46.91 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  47.89 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  48.3 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  45.9 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  38.56 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  30.56 
 
 		 282 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  33.91 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  26.25 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  29.07 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  33.93 
 
 		 767 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>