35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3421 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  100 
 
 		 308 aa  610  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  86.71 
 
 		 305 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  81.61 
 
 		 310 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  86.52 
 
 		 312 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  87.54 
 
 		 302 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  87.54 
 
 		 302 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  86.48 
 
 		 303 aa  474  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  68.11 
 
 		 297 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  69.81 
 
 		 300 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  68.84 
 
 		 304 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  69.64 
 
 		 304 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  70.46 
 
 		 304 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  68.1 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  64.09 
 
 		 331 aa  362  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  67.92 
 
 		 295 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  57.44 
 
 		 307 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  60.37 
 
 		 294 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  59.55 
 
 		 294 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  57.91 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  53.63 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  52.99 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  49.49 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  49.82 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  48.34 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  45.9 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  45.71 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  46.45 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  46.07 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  44.28 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  36.55 
 
 		 274 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  31.69 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  36.78 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  26.82 
 
 		 258 aa  86.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  26.82 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  28 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>