35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1167 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  100 
 
 
305 aa  600  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  90 
 
 
310 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  91.49 
 
 
312 aa  514  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  91.48 
 
 
302 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  91.48 
 
 
302 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  89.18 
 
 
303 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  87.28 
 
 
308 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  72.96 
 
 
300 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  69.33 
 
 
297 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  70.53 
 
 
304 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  71.33 
 
 
304 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  69.82 
 
 
304 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  68.46 
 
 
305 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  68.94 
 
 
295 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  63.04 
 
 
331 aa  358  7e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  54.83 
 
 
307 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  58.89 
 
 
294 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  58.05 
 
 
294 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  55.59 
 
 
307 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  54.3 
 
 
307 aa  278  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  53.31 
 
 
268 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  53.68 
 
 
268 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  52.94 
 
 
268 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  50.18 
 
 
298 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  46.57 
 
 
305 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  46.59 
 
 
303 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  46.3 
 
 
303 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  47.21 
 
 
288 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  43.13 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  38 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  31.83 
 
 
282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  35.52 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  27.82 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  27.57 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  27.17 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>