35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2350 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  93.09 
 
 		 302 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  93.09 
 
 		 302 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  89.18 
 
 		 305 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  83.87 
 
 		 310 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  88.65 
 
 		 312 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  86.52 
 
 		 308 aa  475  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  72.79 
 
 		 300 aa  394  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  68.79 
 
 		 297 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  70.34 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  70 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  69.66 
 
 		 295 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  71.22 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  68.28 
 
 		 305 aa  362  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  66.21 
 
 		 331 aa  359  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  55.02 
 
 		 307 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  60.45 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  58.05 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  56.16 
 
 		 307 aa  285  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  55.48 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  54.3 
 
 		 268 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  50.68 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  52.96 
 
 		 268 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  48.21 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  48.58 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  48.19 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  47.87 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  49.4 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  45.08 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  36.36 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  30.5 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  36.29 
 
 		 255 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  26.72 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  26.72 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  27.76 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>