36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59910 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  584  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  96.6 
 
 
294 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  64.98 
 
 
307 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  61 
 
 
307 aa  351  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  61 
 
 
307 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  62.01 
 
 
304 aa  315  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  60.57 
 
 
304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  59.51 
 
 
304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  58.84 
 
 
305 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  56.64 
 
 
331 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  59.85 
 
 
295 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  59.47 
 
 
308 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  57.84 
 
 
305 aa  291  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  57.62 
 
 
310 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  57.79 
 
 
303 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  54.71 
 
 
297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  57.79 
 
 
302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  57.79 
 
 
302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  57.03 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  56.47 
 
 
300 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  53.49 
 
 
268 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  49.49 
 
 
298 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  47.6 
 
 
306 aa  235  5.0000000000000005e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  47.88 
 
 
288 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  48.7 
 
 
305 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  45.21 
 
 
303 aa  222  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  48.45 
 
 
303 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  48.53 
 
 
268 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  49.61 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  35.45 
 
 
274 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  34.58 
 
 
255 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  30.48 
 
 
282 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  27.68 
 
 
260 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  28.4 
 
 
258 aa  89.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  28.4 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  31.54 
 
 
767 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>