36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4172 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  607  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  93.07 
 
 		 303 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  94.1 
 
 		 305 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  56.15 
 
 		 298 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  59.21 
 
 		 288 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  49.81 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  44.9 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  46.79 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  48.45 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  46.45 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  49.23 
 
 		 304 aa  228  8e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  48.02 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  49.8 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  49.41 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  45.86 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  47.71 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  48.85 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  48.85 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  47.84 
 
 		 302 aa  221  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  47.84 
 
 		 302 aa  221  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  47.67 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  45.14 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  47.22 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  47.88 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  44.77 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  47.92 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  44.77 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  45.79 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  45.05 
 
 		 268 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  33.98 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  33.85 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  28 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  28 
 
 		 258 aa  89  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  28.46 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  27.66 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  38.89 
 
 		 767 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>