36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0505 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  68.32 
 
 
304 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  68.33 
 
 
304 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  66.22 
 
 
304 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  65.65 
 
 
305 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  68.17 
 
 
295 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  65.07 
 
 
310 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  66.19 
 
 
308 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  64.51 
 
 
305 aa  358  7e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  67.61 
 
 
303 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  64.11 
 
 
312 aa  352  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  65.71 
 
 
302 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  65.71 
 
 
302 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  59.93 
 
 
297 aa  344  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  63.05 
 
 
300 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  50.91 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  59.27 
 
 
294 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  58.03 
 
 
294 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  51.06 
 
 
307 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  52.6 
 
 
307 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  48.03 
 
 
268 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  46.53 
 
 
268 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  46.05 
 
 
268 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  46.42 
 
 
298 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  45.05 
 
 
288 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  43.97 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  44.44 
 
 
303 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  42.27 
 
 
303 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  41.26 
 
 
306 aa  195  9e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  34.48 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  28.76 
 
 
282 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  35.5 
 
 
255 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  23.66 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  25.7 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  23.55 
 
 
258 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  33.57 
 
 
767 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>