36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2391 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  590  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  97.37 
 
 
304 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  97.04 
 
 
304 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  77.7 
 
 
305 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  74.74 
 
 
295 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  72.43 
 
 
305 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  70.76 
 
 
310 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  68.12 
 
 
331 aa  374  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  70 
 
 
308 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  70.36 
 
 
312 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  70.29 
 
 
302 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  70.29 
 
 
302 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  68.95 
 
 
297 aa  364  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  73.21 
 
 
303 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  68.73 
 
 
300 aa  346  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  62.45 
 
 
294 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  61.71 
 
 
294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  55.14 
 
 
307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  57.95 
 
 
307 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  54 
 
 
307 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  52.86 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  54.79 
 
 
268 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  54.79 
 
 
268 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  49.33 
 
 
298 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  49.05 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  50.57 
 
 
303 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  50.57 
 
 
305 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  49.43 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  45.75 
 
 
306 aa  203  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  38.21 
 
 
274 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  32.35 
 
 
282 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  36.8 
 
 
255 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  28.35 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  24.15 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  24.15 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  45 
 
 
767 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>