36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0680 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  78.43 
 
 		 304 aa  454  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  78.69 
 
 		 304 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  77.74 
 
 		 304 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  67.82 
 
 		 295 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  64.95 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  68.07 
 
 		 305 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  65.41 
 
 		 331 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  70.26 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  70.04 
 
 		 308 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  66.9 
 
 		 312 aa  359  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  70.94 
 
 		 303 aa  355  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  70.08 
 
 		 302 aa  355  5e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  70.08 
 
 		 302 aa  355  5e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  68.93 
 
 		 300 aa  345  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  62.64 
 
 		 294 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  52.76 
 
 		 307 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  60.75 
 
 		 294 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  55.71 
 
 		 307 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  53.64 
 
 		 307 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  53.52 
 
 		 268 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  51.81 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  53.46 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  47.33 
 
 		 298 aa  221  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  48.59 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  45.69 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  45.28 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  46.33 
 
 		 303 aa  208  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  43.19 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  39.55 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  37.97 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  29.93 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  25.28 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  25.84 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  24.91 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  44.26 
 
 		 767 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>