36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0862 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  92.81 
 
 		 307 aa  527  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  63.37 
 
 		 307 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  62.5 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  62.14 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  55.48 
 
 		 304 aa  309  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  55.14 
 
 		 304 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  54.48 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  50.91 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  52.76 
 
 		 305 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  56.88 
 
 		 310 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  58.24 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  56.07 
 
 		 305 aa  299  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  53.58 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  56.36 
 
 		 312 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  57.14 
 
 		 302 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  57.14 
 
 		 302 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  55.51 
 
 		 303 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  54.91 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  55.79 
 
 		 300 aa  271  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  51.76 
 
 		 268 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  48.56 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  49.23 
 
 		 298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  47.14 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  45.45 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  45.36 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  44.59 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  47.71 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  46.07 
 
 		 303 aa  222  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  35.16 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  27.34 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  28.92 
 
 		 255 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  26.16 
 
 		 260 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  28.06 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  26.26 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  28.97 
 
 		 767 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>