35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0438 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  100 
 
 
297 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  78.33 
 
 
300 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  70.63 
 
 
305 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  70.98 
 
 
310 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  70.97 
 
 
302 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  70.97 
 
 
302 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  69.5 
 
 
308 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  68.79 
 
 
312 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  70 
 
 
303 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  68.95 
 
 
304 aa  364  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  67.27 
 
 
305 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  67.15 
 
 
304 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  67.87 
 
 
304 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  60.94 
 
 
331 aa  342  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  64.96 
 
 
295 aa  340  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  54.91 
 
 
307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  56.18 
 
 
294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  55.43 
 
 
294 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  52.94 
 
 
307 aa  272  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  51.7 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  52.03 
 
 
268 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  50.92 
 
 
268 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  51.13 
 
 
268 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  47.62 
 
 
298 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  48.03 
 
 
288 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  44.77 
 
 
303 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  44.52 
 
 
305 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  43.96 
 
 
303 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  45 
 
 
306 aa  192  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  35.74 
 
 
274 aa  132  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  31.45 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  36.4 
 
 
255 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  27.69 
 
 
258 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  27.69 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  26.47 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>