36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0657 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  64.79 
 
 
288 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  57.29 
 
 
303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  55.81 
 
 
303 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  56.94 
 
 
305 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  46.79 
 
 
306 aa  263  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  50 
 
 
294 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  50 
 
 
310 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  48.67 
 
 
304 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  49.62 
 
 
307 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  48.41 
 
 
294 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  48.33 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  50.58 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  49.15 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  50.98 
 
 
302 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  50.98 
 
 
302 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  46.76 
 
 
307 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  50.59 
 
 
303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  48.35 
 
 
297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  48.63 
 
 
312 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  49.1 
 
 
295 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  46.81 
 
 
307 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  46.07 
 
 
268 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  49.61 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  47.1 
 
 
300 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  47.52 
 
 
305 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  46.42 
 
 
331 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  46.3 
 
 
268 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  44.49 
 
 
268 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  32.97 
 
 
274 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  33.22 
 
 
282 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  31.15 
 
 
255 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  28.17 
 
 
258 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  29.41 
 
 
258 aa  89.7  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  26.57 
 
 
260 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  31.13 
 
 
767 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>