36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1761 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1761  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0657  hypothetical protein  46.15 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4172  hypothetical protein  50 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3708  hypothetical protein  48.79 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0334  hypothetical protein  49.81 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59910  hypothetical protein  47.39 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437823  hitchhiker  0.00000000000176857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4089  hypothetical protein  48.68 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4512  hypothetical protein  47.01 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0862  hypothetical protein  47.71 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3020  hypothetical protein  47.06 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.508615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36250  hypothetical protein  43.75 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.650089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1445  hypothetical protein  45.94 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2189  hypothetical protein  46.56 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1187  hypothetical protein  42.16 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2350  hypothetical protein  43.89 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000728086  unclonable  0.000000168621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2391  hypothetical protein  45.75 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0951  hypothetical protein  45.75 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1401  putative secreted protein  44.02 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1259  putative secreted protein  44.02 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.21824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3421  putative secreted protein  43.68 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1167  putative secreted protein  42.53 
 
 		 305 aa  199  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0505  hypothetical protein  38.87 
 
 		 331 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2856  hypothetical protein  45.24 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0438  putative signal peptide  43.17 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4176  putative signal peptide  42.53 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150173  normal  0.787284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0680  hypothetical protein  43.19 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2945  hypothetical protein  42.41 
 
 		 268 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3327  hypothetical protein  41.63 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1629  putative secreted protein  43.58 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0645  hypothetical protein  35.17 
 
 		 274 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3929  hypothetical protein  32.37 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2758  hypothetical protein  31.65 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2389  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1025  hypothetical protein  26.2 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1063  hypothetical protein  25.46 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  30 
 
 		 767 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>