123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2896 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2896  transposase  100 
 
 		 77 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  74.03 
 
 		 345 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  74.03 
 
 		 345 aa  123  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  74.03 
 
 		 345 aa  123  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  72.73 
 
 		 345 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  68.49 
 
 		 343 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  68.49 
 
 		 343 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  68.49 
 
 		 343 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  55.84 
 
 		 343 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  54.55 
 
 		 343 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  51.95 
 
 		 343 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2577  IS630 orf  60.66 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.093225  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0065  IS630, transposase, truncation  57.78 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0042  IS630, transposase, truncation  55.56 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  52.17 
 
 		 363 aa  53.9  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  43.75 
 
 		 360 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  35.71 
 
 		 353 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  35.71 
 
 		 351 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  35.19 
 
 		 375 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  35.71 
 
 		 194 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  39.58 
 
 		 357 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  39.58 
 
 		 357 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  39.58 
 
 		 357 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  39.58 
 
 		 357 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  39.58 
 
 		 357 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  30.16 
 
 		 356 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1944  hypothetical protein  45 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.181945  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  41.3 
 
 		 346 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  43.48 
 
 		 355 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 		 363 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3844  putative transposase  41.67 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.585584  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 		 363 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 		 363 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 		 363 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4694  hypothetical protein  40 
 
 		 337 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  37.78 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  30.16 
 
 		 361 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  30.16 
 
 		 361 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  37.25 
 
 		 351 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 353 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 353 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 353 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 353 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  41.03 
 
 		 363 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  40.35 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  39.13 
 
 		 356 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3798  hypothetical protein  37.5 
 
 		 327 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  39.53 
 
 		 365 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  38.3 
 
 		 351 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  38.6 
 
 		 355 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  38.6 
 
 		 355 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  38.6 
 
 		 355 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 353 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 353 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  30.65 
 
 		 379 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  36.96 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  36.96 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  36.96 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  39.29 
 
 		 348 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  41.3 
 
 		 342 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  41.3 
 
 		 342 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  41.3 
 
 		 342 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  30.95 
 
 		 362 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  30.95 
 
 		 362 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  30.95 
 
 		 362 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  30.95 
 
 		 340 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  30.95 
 
 		 362 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  40 
 
 		 389 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00650  isrso5-transposase protein  37.5 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0193031  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  40 
 
 		 362 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  40 
 
 		 362 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  40 
 
 		 362 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  33.33 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  35.56 
 
 		 362 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  40.48 
 
 		 363 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  40.48 
 
 		 626 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>