55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0065 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0065  IS630, transposase, truncation  100 
 
 		 72 aa  153  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0042  IS630, transposase, truncation  95.83 
 
 		 72 aa  146  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  91.67 
 
 		 343 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  91.43 
 
 		 343 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  88.73 
 
 		 343 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2577  IS630 orf  68.57 
 
 		 86 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.093225  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  67.61 
 
 		 345 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  67.61 
 
 		 345 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  68.57 
 
 		 343 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  68.57 
 
 		 343 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  68.57 
 
 		 343 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  66.2 
 
 		 345 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  66.2 
 
 		 345 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0038  description: insertion element; ORF5 protein  77.78 
 
 		 46 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2896  transposase  57.78 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 		 375 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  36.51 
 
 		 356 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 		 363 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 		 363 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 		 363 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 		 363 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 		 363 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 		 363 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 		 363 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 		 363 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  35.19 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  34.38 
 
 		 363 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  34.38 
 
 		 363 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  34.38 
 
 		 363 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  35.94 
 
 		 363 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0953  ISRSO5-transposase protein  30.3 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0694776  normal  0.301746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  33.33 
 
 		 361 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  33.33 
 
 		 361 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  35.48 
 
 		 362 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  30.65 
 
 		 364 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  29.09 
 
 		 360 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  32.81 
 
 		 356 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  32.81 
 
 		 356 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  32.81 
 
 		 356 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>