146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2577 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2577  IS630 orf  100 
 
 
86 aa  181  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.093225  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  67.44 
 
 
343 aa  140  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  65.12 
 
 
343 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  68.6 
 
 
343 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  72.09 
 
 
343 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  72.09 
 
 
343 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  72.09 
 
 
343 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  61.63 
 
 
345 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  61.63 
 
 
345 aa  124  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  60.47 
 
 
345 aa  122  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  60.47 
 
 
345 aa  122  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0065  IS630, transposase, truncation  68.57 
 
 
72 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0042  IS630, transposase, truncation  68.57 
 
 
72 aa  114  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2896  transposase  60.66 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0038  description: insertion element; ORF5 protein  60 
 
 
46 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  33.8 
 
 
360 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  33.75 
 
 
363 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  30.38 
 
 
356 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 
359 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  31.65 
 
 
363 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  31.65 
 
 
363 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  31.65 
 
 
363 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  27.85 
 
 
361 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  27.85 
 
 
361 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  31.88 
 
 
363 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  30.38 
 
 
389 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  30.38 
 
 
362 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  30.38 
 
 
362 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  30.38 
 
 
362 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  32.91 
 
 
362 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  31.88 
 
 
375 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  31.65 
 
 
364 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  29.11 
 
 
363 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  29.11 
 
 
363 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  29.11 
 
 
363 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  29.11 
 
 
363 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  29.11 
 
 
363 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  29.11 
 
 
363 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  29.11 
 
 
363 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  29.11 
 
 
363 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  24.68 
 
 
362 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1944  hypothetical protein  32.91 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.181945  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  28.24 
 
 
361 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  28.24 
 
 
361 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  28.24 
 
 
361 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  24.68 
 
 
362 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  44.19 
 
 
365 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  30.77 
 
 
359 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  30.43 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  31.65 
 
 
367 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  31.65 
 
 
367 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  29.11 
 
 
362 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  29.11 
 
 
362 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  29.11 
 
 
362 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  29.11 
 
 
340 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  29.11 
 
 
362 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  28.57 
 
 
365 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  25 
 
 
362 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  30.38 
 
 
362 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  30.38 
 
 
362 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  30.38 
 
 
362 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  30.38 
 
 
362 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  30.38 
 
 
362 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  30.38 
 
 
362 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  36.36 
 
 
363 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00650  isrso5-transposase protein  29.07 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0193031  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  31.65 
 
 
370 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  30.77 
 
 
168 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  30.38 
 
 
363 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  27.91 
 
 
370 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  27.91 
 
 
370 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  30.38 
 
 
363 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  30.38 
 
 
363 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 
626 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>