34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0042 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0042  IS630, transposase, truncation  100 
 
 		 72 aa  152  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0065  IS630, transposase, truncation  95.83 
 
 		 72 aa  146  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  90.28 
 
 		 343 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  87.32 
 
 		 343 aa  141  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  90 
 
 		 343 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2577  IS630 orf  68.57 
 
 		 86 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.093225  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  67.14 
 
 		 343 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  67.14 
 
 		 343 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  67.14 
 
 		 343 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  63.38 
 
 		 345 aa  104  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  63.38 
 
 		 345 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  61.97 
 
 		 345 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  61.97 
 
 		 345 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0038  description: insertion element; ORF5 protein  77.78 
 
 		 46 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2896  transposase  55.56 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  34.43 
 
 		 356 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  35.19 
 
 		 375 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  35.19 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  35.19 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  35.19 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  35.19 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  35.19 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  35.19 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  35.19 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  35.19 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  33.33 
 
 		 363 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  32.81 
 
 		 363 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  32.81 
 
 		 363 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  32.81 
 
 		 363 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  35.19 
 
 		 179 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  35.48 
 
 		 362 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  32.81 
 
 		 363 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  33.33 
 
 		 361 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  33.33 
 
 		 361 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>