More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1005 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_25590  phosphomannomutase  61.01 
 
 
622 aa  672    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.635633 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0834  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  59.42 
 
 
600 aa  647    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1005  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  100 
 
 
595 aa  1174    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08160  phosphomannomutase  53.39 
 
 
573 aa  549  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1260  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  55.02 
 
 
595 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2934  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  60.89 
 
 
591 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1307  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  55.07 
 
 
585 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1030  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  59.51 
 
 
614 aa  528  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3925  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  59.06 
 
 
564 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0689871  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21190  phosphomannomutase  53.49 
 
 
575 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3526  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  53.99 
 
 
550 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1282  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  51.94 
 
 
547 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0773  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  49.66 
 
 
553 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0686  glucose-1,6-bisphosphate synthase  51.1 
 
 
545 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3245  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  51.53 
 
 
556 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590925  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4183  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  51.16 
 
 
558 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4380  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  51.68 
 
 
539 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.973187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5923  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  53.55 
 
 
597 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2498  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  49.92 
 
 
562 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0830  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  50.5 
 
 
568 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0774  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  50 
 
 
566 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05600  phosphomannomutase  53.97 
 
 
573 aa  442  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229277  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1670  phosphomannomutase  44.33 
 
 
552 aa  444  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1352  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  50.84 
 
 
561 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.444241  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0803  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  48.91 
 
 
563 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.515302  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0690  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.76 
 
 
680 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6422  Phosphomannomutase  47.95 
 
 
542 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05620  phosphomannomutase  47.55 
 
 
550 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001444  phosphosugar mutase  43.2 
 
 
564 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2541  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.28 
 
 
573 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  48.26 
 
 
529 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794762  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2608  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.78 
 
 
573 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2707  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.44 
 
 
573 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1607  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  47.47 
 
 
532 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1517  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.33 
 
 
582 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1555  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.76 
 
 
573 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06273  phosphomannomutase  42.42 
 
 
566 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  42.07 
 
 
573 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1590  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.47 
 
 
573 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2727  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.62 
 
 
577 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.476047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1561  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.33 
 
 
573 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0982  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  45.61 
 
 
541 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2789  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.47 
 
 
573 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897938  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42 
 
 
573 aa  372  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2544  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.75 
 
 
584 aa  364  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2159  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.93 
 
 
573 aa  360  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.580112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3151  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.87 
 
 
577 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.492752  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0200  putative phosphomannomutase  39.83 
 
 
567 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.352452  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1241  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.83 
 
 
545 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184013  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1258  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.83 
 
 
545 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.644814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1268  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.56 
 
 
545 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13337  phosphomannomutase pmmB  45.08 
 
 
534 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1189  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  42 
 
 
585 aa  332  9e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1966  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.95 
 
 
582 aa  330  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0757  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.19 
 
 
574 aa  323  7e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2334  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  33.66 
 
 
577 aa  320  6e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0873  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.58 
 
 
564 aa  309  8e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11243  phosphoglucomutase phosphomannomutase  32.68 
 
 
575 aa  304  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.353227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4741  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.54 
 
 
574 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0958  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.82 
 
 
574 aa  300  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1066  phosphoglucomutase  35.33 
 
 
572 aa  300  5e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00652897  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0998  phosphomannomutase  33 
 
 
579 aa  300  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.133483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5884  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.11 
 
 
574 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.830528 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1998  phosphohexose mutase family protein  30.97 
 
 
587 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0493  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34 
 
 
564 aa  296  5e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0407354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.37 
 
 
574 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.477759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4631  phosphomannomutase  35.37 
 
 
574 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.803667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5051  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.37 
 
 
574 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5153  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.37 
 
 
574 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.37 
 
 
574 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5030  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.37 
 
 
574 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4651  phosphomannomutase  35.37 
 
 
574 aa  295  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07360  phosphomannomutase  36.26 
 
 
566 aa  293  6e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0130531  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0183  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.1 
 
 
574 aa  293  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5058  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.37 
 
 
574 aa  293  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0833  phosphoglucomutase  36.11 
 
 
572 aa  291  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1761  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.55 
 
 
577 aa  290  6e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0800235  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2071  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  31.58 
 
 
563 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1857  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.83 
 
 
559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1388  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  36.76 
 
 
585 aa  283  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17410  alpha-phosphoglucomutase  32.04 
 
 
581 aa  282  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3530  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.14 
 
 
574 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2578  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.63 
 
 
577 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4939  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.17 
 
 
587 aa  280  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0864  phosphomannomutase  30.16 
 
 
569 aa  280  7e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.29 
 
 
585 aa  280  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0112  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.11 
 
 
575 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1378  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.27 
 
 
575 aa  278  3e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1417  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.68 
 
 
576 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1841  phosphomannomutase  32.9 
 
 
575 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354389  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl120  phosphomannomutase/phosphoglucomutase-like protein  34.54 
 
 
561 aa  272  1e-71  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2127  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.9 
 
 
575 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.194048  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0528  Phosphomannomutase  34.65 
 
 
582 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2010  phosphomannomutase, putative  35.66 
 
 
550 aa  270  4e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0606  alpha-phosphoglucomutase  33.75 
 
 
566 aa  270  5.9999999999999995e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0586791  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0380  alpha-phosphoglucomutase  35.04 
 
 
574 aa  270  8e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.274012  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23220  phosphomannomutase  34.44 
 
 
570 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91072  Phosphoglucomutase/phosphomannomutase  33.11 
 
 
629 aa  262  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1265  alpha-phosphoglucomutase  31.29 
 
 
578 aa  261  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2055  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.4 
 
 
546 aa  259  7e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.670754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>