More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2608 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1517  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  71.82 
 
 
582 aa  861    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  93.19 
 
 
573 aa  1092    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2789  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  87.61 
 
 
573 aa  1049    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897938  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3151  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  74.18 
 
 
577 aa  887    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.492752  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2727  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  73.83 
 
 
577 aa  877    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.476047  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06273  phosphomannomutase  62.85 
 
 
566 aa  717    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001444  phosphosugar mutase  64.12 
 
 
564 aa  715    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  87.78 
 
 
573 aa  1046    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2544  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  68.44 
 
 
584 aa  812    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0200  putative phosphomannomutase  65.6 
 
 
567 aa  754    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.352452  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1966  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  69.24 
 
 
582 aa  825    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2541  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  98.43 
 
 
573 aa  1168    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2608  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 
573 aa  1184    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2159  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  78.88 
 
 
573 aa  939    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.580112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2707  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  97.91 
 
 
573 aa  1163    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1189  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  63.42 
 
 
585 aa  759    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1555  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  87.96 
 
 
573 aa  1050    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1590  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  88.13 
 
 
573 aa  1056    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1561  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  88.48 
 
 
573 aa  1055    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1282  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  45.09 
 
 
547 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4183  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  46.19 
 
 
558 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0686  glucose-1,6-bisphosphate synthase  45.13 
 
 
545 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3526  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.36 
 
 
550 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1998  phosphohexose mutase family protein  38.04 
 
 
587 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1005  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.85 
 
 
595 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3245  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.09 
 
 
556 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590925  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25590  phosphomannomutase  40.58 
 
 
622 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.635633 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0834  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.13 
 
 
600 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1670  phosphomannomutase  39.9 
 
 
552 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104269  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2071  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  35.2 
 
 
563 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08160  phosphomannomutase  40.64 
 
 
573 aa  365  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1307  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.17 
 
 
585 aa  365  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21190  phosphomannomutase  41.2 
 
 
575 aa  363  6e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0958  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.28 
 
 
574 aa  362  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0998  phosphomannomutase  35.55 
 
 
579 aa  359  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.133483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1260  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.24 
 
 
595 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2578  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.75 
 
 
577 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0830  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.95 
 
 
568 aa  353  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0773  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  40.62 
 
 
553 aa  352  8e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4380  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  40.77 
 
 
539 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.973187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5923  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.4 
 
 
597 aa  350  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.81 
 
 
585 aa  350  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0774  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.13 
 
 
566 aa  350  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5884  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.06 
 
 
574 aa  350  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.830528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6422  Phosphomannomutase  43.29 
 
 
542 aa  349  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3925  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.24 
 
 
564 aa  342  9e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0689871  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17410  alpha-phosphoglucomutase  36.59 
 
 
581 aa  340  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0803  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.83 
 
 
563 aa  340  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.515302  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0757  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.68 
 
 
574 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11243  phosphoglucomutase phosphomannomutase  34.23 
 
 
575 aa  337  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.353227  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2334  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  35.12 
 
 
577 aa  336  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.83 
 
 
574 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0606  alpha-phosphoglucomutase  38.59 
 
 
566 aa  335  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0586791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5058  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.28 
 
 
574 aa  334  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5051  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.46 
 
 
574 aa  333  6e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4741  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.64 
 
 
574 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.1 
 
 
574 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.477759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4631  phosphomannomutase  36.1 
 
 
574 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.803667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5030  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.1 
 
 
574 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2261  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.2 
 
 
573 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.775118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5153  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.1 
 
 
574 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4651  phosphomannomutase  36.1 
 
 
574 aa  332  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4939  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.33 
 
 
587 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0183  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.28 
 
 
574 aa  332  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1417  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.68 
 
 
576 aa  330  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0380  alpha-phosphoglucomutase  36.09 
 
 
574 aa  330  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.274012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1265  alpha-phosphoglucomutase  35.83 
 
 
578 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2060  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.16 
 
 
568 aa  329  7e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.102026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2498  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  40.75 
 
 
562 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1241  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.89 
 
 
545 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184013  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1258  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.89 
 
 
545 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.644814 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3530  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.12 
 
 
574 aa  327  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2815  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.6 
 
 
575 aa  327  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000103083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0982  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  42.29 
 
 
541 aa  326  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.27 
 
 
529 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794762  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1268  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.89 
 
 
545 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1761  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.36 
 
 
577 aa  323  4e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0800235  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0112  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.54 
 
 
575 aa  323  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1066  phosphoglucomutase  34.91 
 
 
572 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00652897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0528  Phosphomannomutase  37.57 
 
 
582 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1030  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  41.32 
 
 
614 aa  320  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1388  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  36.38 
 
 
585 aa  320  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2934  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.45 
 
 
591 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05620  phosphomannomutase  39.12 
 
 
550 aa  318  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05600  phosphomannomutase  41.47 
 
 
573 aa  317  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1841  phosphomannomutase  34.12 
 
 
575 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354389  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0833  phosphoglucomutase  35.78 
 
 
572 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2127  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.94 
 
 
575 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.194048  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0690  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.36 
 
 
680 aa  312  9e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0864  phosphomannomutase  33.58 
 
 
569 aa  312  1e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07360  phosphomannomutase  34.37 
 
 
566 aa  312  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0130531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1607  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.31 
 
 
532 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0873  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.69 
 
 
564 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2010  phosphomannomutase, putative  35.1 
 
 
550 aa  309  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1352  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  41.51 
 
 
561 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.444241  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.36 
 
 
573 aa  303  6.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.577689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0493  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.1 
 
 
564 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0407354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13337  phosphomannomutase pmmB  39.59 
 
 
534 aa  303  8.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1378  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.78 
 
 
575 aa  298  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91072  Phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.93 
 
 
629 aa  294  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>