More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2544 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  68.21 
 
 
573 aa  798    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2727  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  69.17 
 
 
577 aa  830    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.476047  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06273  phosphomannomutase  59 
 
 
566 aa  665    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001444  phosphosugar mutase  59.97 
 
 
564 aa  668    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1517  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  68.32 
 
 
582 aa  820    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1555  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  68.27 
 
 
573 aa  810    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  67.92 
 
 
573 aa  803    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2789  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  68.38 
 
 
573 aa  810    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897938  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3151  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  70.87 
 
 
577 aa  841    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.492752  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1966  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  61.38 
 
 
582 aa  721    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2544  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 
584 aa  1199    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2541  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  68.44 
 
 
573 aa  811    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2608  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  68.44 
 
 
573 aa  812    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2159  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  64.32 
 
 
573 aa  763    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.580112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1590  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  68.61 
 
 
573 aa  816    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2707  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  68.44 
 
 
573 aa  810    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1189  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  58.42 
 
 
585 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0200  putative phosphomannomutase  61.01 
 
 
567 aa  699    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.352452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1561  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  68.1 
 
 
573 aa  808    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4183  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  45.68 
 
 
558 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1282  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  43.53 
 
 
547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0686  glucose-1,6-bisphosphate synthase  44.32 
 
 
545 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1998  phosphohexose mutase family protein  36.11 
 
 
587 aa  385  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0834  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.17 
 
 
600 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21190  phosphomannomutase  42.66 
 
 
575 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3245  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.63 
 
 
556 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590925  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25590  phosphomannomutase  41.5 
 
 
622 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.635633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3526  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.74 
 
 
550 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1670  phosphomannomutase  40.22 
 
 
552 aa  362  1e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104269  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2071  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  34.94 
 
 
563 aa  361  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1005  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.01 
 
 
595 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5884  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.41 
 
 
574 aa  356  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.830528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5923  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.75 
 
 
597 aa  350  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08160  phosphomannomutase  39.82 
 
 
573 aa  350  5e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0803  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.29 
 
 
563 aa  349  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.515302  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1260  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.42 
 
 
595 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1307  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.83 
 
 
585 aa  347  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2578  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.32 
 
 
577 aa  346  8e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0774  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.89 
 
 
566 aa  343  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2815  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.77 
 
 
575 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000103083  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2334  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  34.78 
 
 
577 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.35 
 
 
585 aa  336  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0998  phosphomannomutase  32.82 
 
 
579 aa  336  7e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.133483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17410  alpha-phosphoglucomutase  35.14 
 
 
581 aa  335  9e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0606  alpha-phosphoglucomutase  36.96 
 
 
566 aa  334  3e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0586791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0830  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.46 
 
 
568 aa  333  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4380  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  41.59 
 
 
539 aa  332  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.973187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1607  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.86 
 
 
532 aa  329  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0773  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  38.64 
 
 
553 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.47 
 
 
529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794762  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2934  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.62 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0757  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.54 
 
 
574 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3925  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.56 
 
 
564 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0689871  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2060  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.08 
 
 
568 aa  325  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.102026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.76 
 
 
574 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5051  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.76 
 
 
574 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0528  Phosphomannomutase  37.24 
 
 
582 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5058  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.4 
 
 
574 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4939  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.64 
 
 
587 aa  324  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1352  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  41.84 
 
 
561 aa  323  7e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.444241  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0982  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  41.65 
 
 
541 aa  323  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.4 
 
 
574 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.477759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4631  phosphomannomutase  34.4 
 
 
574 aa  322  8e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.803667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5030  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.4 
 
 
574 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5153  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.4 
 
 
574 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4741  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.4 
 
 
574 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4651  phosphomannomutase  34.22 
 
 
574 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11243  phosphoglucomutase phosphomannomutase  32.88 
 
 
575 aa  322  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.353227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0958  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.47 
 
 
574 aa  321  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0183  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.22 
 
 
574 aa  321  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3530  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.83 
 
 
574 aa  321  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2261  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.56 
 
 
573 aa  318  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.775118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6422  Phosphomannomutase  42.63 
 
 
542 aa  317  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0833  phosphoglucomutase  35.27 
 
 
572 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05620  phosphomannomutase  40.93 
 
 
550 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2498  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  39.51 
 
 
562 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1388  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  35.86 
 
 
585 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.92 
 
 
573 aa  313  4.999999999999999e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.555777  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0380  alpha-phosphoglucomutase  34.07 
 
 
574 aa  313  6.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.274012  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0864  phosphomannomutase  30.61 
 
 
569 aa  313  6.999999999999999e-84  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2127  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.76 
 
 
575 aa  312  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.194048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1841  phosphomannomutase  34.76 
 
 
575 aa  312  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07360  phosphomannomutase  34.83 
 
 
566 aa  311  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0130531  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1066  phosphoglucomutase  33.45 
 
 
572 aa  310  5.9999999999999995e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00652897  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1761  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.87 
 
 
577 aa  309  8e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0800235  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1241  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.26 
 
 
545 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184013  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1258  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.26 
 
 
545 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.644814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1268  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.55 
 
 
545 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1030  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  39.97 
 
 
614 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0493  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.03 
 
 
564 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0407354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1265  alpha-phosphoglucomutase  33.69 
 
 
578 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23220  phosphomannomutase  35.36 
 
 
570 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1417  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.33 
 
 
576 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0112  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.21 
 
 
575 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0873  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.49 
 
 
564 aa  300  5e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0690  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.44 
 
 
680 aa  294  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1857  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.9 
 
 
559 aa  294  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91072  Phosphoglucomutase/phosphomannomutase  33.72 
 
 
629 aa  293  5e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2010  phosphomannomutase, putative  34.53 
 
 
550 aa  292  1e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05600  phosphomannomutase  38.58 
 
 
573 aa  288  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>