More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1042 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1042  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  92.16 
 
 		 290 aa  194  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  92.16 
 
 		 290 aa  194  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  88.24 
 
 		 290 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  88.24 
 
 		 290 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  83.33 
 
 		 290 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  72.55 
 
 		 307 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  70.3 
 
 		 309 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  71.57 
 
 		 309 aa  154  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  71.57 
 
 		 309 aa  154  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  71.57 
 
 		 309 aa  154  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  67.27 
 
 		 235 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  63.39 
 
 		 309 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  63.39 
 
 		 309 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  63.39 
 
 		 309 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  61.4 
 
 		 309 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  63.39 
 
 		 309 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  62.5 
 
 		 309 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  62.5 
 
 		 309 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  62.5 
 
 		 375 aa  144  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  61.61 
 
 		 309 aa  141  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  63 
 
 		 189 aa  137  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 306 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  62 
 
 		 260 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  63 
 
 		 393 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  67 
 
 		 284 aa  130  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  61.76 
 
 		 312 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  61.22 
 
 		 269 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  61.22 
 
 		 269 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  61.22 
 
 		 269 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  61.22 
 
 		 269 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0607  integrase catalytic region  48.63 
 
 		 233 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0782  hypothetical protein  59.62 
 
 		 138 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  59.18 
 
 		 372 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  59.18 
 
 		 372 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  59.18 
 
 		 372 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  59.18 
 
 		 372 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  59.18 
 
 		 372 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  59.18 
 
 		 372 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  59.18 
 
 		 372 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  59.18 
 
 		 372 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  59.18 
 
 		 372 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  59.18 
 
 		 372 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1166  integrase catalytic region  58 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  57.29 
 
 		 273 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  57.29 
 
 		 273 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  57.29 
 
 		 273 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  57.29 
 
 		 273 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  57.29 
 
 		 273 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  54.17 
 
 		 264 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  69.57 
 
 		 231 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  63.29 
 
 		 274 aa  107  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03720  transposase  51 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4081  integrase catalytic region  54.08 
 
 		 210 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  55.1 
 
 		 269 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01161  transposase  50 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  50 
 
 		 281 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0001  integrase core subunit  54.08 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.274298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  49.53 
 
 		 281 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02161  transposase  50 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  48.21 
 
 		 275 aa  104  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  48.21 
 
 		 275 aa  104  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  48.21 
 
 		 275 aa  104  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  48.21 
 
 		 275 aa  104  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  49 
 
 		 281 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  49 
 
 		 281 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  49 
 
 		 281 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  49 
 
 		 281 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02564  transposase  49 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00281  transposase  49 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  48 
 
 		 281 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  48 
 
 		 281 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0024  integrase core domain protein  53.06 
 
 		 276 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.73785  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  48 
 
 		 281 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  48 
 
 		 281 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  48 
 
 		 281 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01541  transposase  48 
 
 		 114 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.728343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  46.85 
 
 		 281 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  48.48 
 
 		 280 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3477  IS407A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3523  A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0008  IS407A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0026  IS407A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0068  IS1404 transposase  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0117  IS407A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0159  IS1404 transposase  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0183  IS407A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0263  IS407A, transposase OrfB  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0587266  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0301  IS1404 transposase  48.62 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>