More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0607 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0607  integrase catalytic region  100 
 
 
233 aa  477  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  82.07 
 
 
309 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  82.07 
 
 
309 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  82.07 
 
 
309 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  77.37 
 
 
307 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  65.42 
 
 
290 aa  313  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  65.42 
 
 
290 aa  313  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  76.32 
 
 
309 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  65.42 
 
 
290 aa  310  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  65.42 
 
 
290 aa  310  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  78.42 
 
 
290 aa  297  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  69.57 
 
 
312 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  65.8 
 
 
260 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  68.68 
 
 
269 aa  261  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  67.93 
 
 
284 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  68.13 
 
 
231 aa  261  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  68.68 
 
 
269 aa  261  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  67.58 
 
 
372 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  67.58 
 
 
372 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  67.58 
 
 
372 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  67.58 
 
 
372 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  67.58 
 
 
372 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  67.58 
 
 
372 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  67.58 
 
 
372 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  67.58 
 
 
372 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  67.58 
 
 
372 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  67.58 
 
 
372 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  68.13 
 
 
269 aa  259  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  68.13 
 
 
269 aa  259  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  64.09 
 
 
237 aa  255  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  64.09 
 
 
237 aa  255  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  64.09 
 
 
237 aa  255  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  64.09 
 
 
237 aa  255  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  61.38 
 
 
273 aa  251  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  61.38 
 
 
273 aa  251  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  61.38 
 
 
273 aa  251  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  61.38 
 
 
273 aa  251  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  61.38 
 
 
273 aa  251  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  56.62 
 
 
264 aa  244  6e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  59.62 
 
 
393 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  64.13 
 
 
274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  63.64 
 
 
309 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  63.64 
 
 
309 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  63.64 
 
 
309 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  63.64 
 
 
375 aa  232  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  62.57 
 
 
309 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  62.57 
 
 
309 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  62.57 
 
 
309 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  62.57 
 
 
309 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  62.03 
 
 
309 aa  228  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  65.17 
 
 
306 aa  228  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1166  integrase catalytic region  65.27 
 
 
223 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0806  hypothetical protein  64 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  62.58 
 
 
235 aa  194  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  56.35 
 
 
269 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  49.28 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0167  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000489876  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1077  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2087  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.879853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2268  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2283  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64128  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0751  A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2145  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0578  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00042542  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2120  A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0978  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.43017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1313  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0188  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0908748  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0283  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010372  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0156  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2092  IS1404 transposase  49.28 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.702251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0531  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603629  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1243  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1654  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1688  IS1404 transposase  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.722668  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1715  IS407A, transposase OrfB  49.28 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0670836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>