More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4518 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4518  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
275 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0534801  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
277 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 
279 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
279 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  37.31 
 
 
269 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
286 aa  161  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
276 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
277 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
283 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.29 
 
 
283 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
276 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
299 aa  158  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
275 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
270 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
277 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
311 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.2 
 
 
278 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
299 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
306 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
275 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
275 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.8 
 
 
297 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0519592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.88 
 
 
298 aa  151  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1617  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
291 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
289 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
283 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
277 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
274 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
275 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
270 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 
277 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
282 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
274 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
280 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
277 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
288 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
275 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
298 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
281 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
274 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  32.52 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
276 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.2 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.36 
 
 
283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 
275 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
285 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
297 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2532  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.12 
 
 
275 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
275 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1810  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 
280 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.817708  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 
302 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
277 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
316 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 
292 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
298 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
273 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
275 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
274 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
275 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
283 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0750  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.46 
 
 
275 aa  142  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
281 aa  142  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1754  putative ABC transporter (permease protein)  33.99 
 
 
274 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  0.512561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
294 aa  141  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
275 aa  141  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.2 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  32 
 
 
291 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
290 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
278 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
285 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
283 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  32 
 
 
291 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
293 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
275 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.965768  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16619  normal  0.170584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0700  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3104  ABC transporter, permease component  35.83 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.48 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>