51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2081 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  72.97 
 
 		 116 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  72.97 
 
 		 116 aa  164  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  74.77 
 
 		 116 aa  164  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  72.07 
 
 		 116 aa  163  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  72.73 
 
 		 116 aa  157  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  69.3 
 
 		 116 aa  156  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  73.87 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  70.54 
 
 		 116 aa  150  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  67.57 
 
 		 116 aa  147  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  65.22 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  61.4 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  55.36 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  58.04 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  62.63 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  53.15 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  61.63 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  49.12 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  50.44 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  50.45 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  46.49 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  48.67 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  48.65 
 
 		 160 aa  97.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  50 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  47.37 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  48.7 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  48.67 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  44.74 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  44.74 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  46.23 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  47.75 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  52.25 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  46.85 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  44.74 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  50.46 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  45.22 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  46.36 
 
 		 193 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  47.75 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  47.62 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  48.65 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  51.55 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  48.62 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  45.95 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  45.45 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  46.85 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  46.85 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4449  hypothetical protein  51.79 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000448491 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  49.21 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  36.84 
 
 		 1716 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4214  hypothetical protein  35.9 
 
 		 340 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>