49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2010 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  244  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  70.34 
 
 
123 aa  157  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  66.67 
 
 
123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  63.41 
 
 
123 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  62.6 
 
 
123 aa  141  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  59.02 
 
 
131 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  61.06 
 
 
131 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  58.87 
 
 
134 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  64.36 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  53.23 
 
 
135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  44.96 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  48.21 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  47.75 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  52.38 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  45.13 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  48.08 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  45.13 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  47.75 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  47.12 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  47.27 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  47.12 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  46.15 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  45.45 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  49.04 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  46.36 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  43.64 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  40.38 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  48.48 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  40.38 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  41.05 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  32.17 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  38.46 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  38.46 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  49.18 
 
 
97 aa  60.8  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  37.5 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  37.63 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  37.5 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  36.54 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  37.5 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  37.93 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  39.42 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  37.62 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  38.46 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  36.78 
 
 
197 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  38.46 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  37.5 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  36.54 
 
 
116 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4449  hypothetical protein  45.61 
 
 
266 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000448491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>