48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1543 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  260  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  80.15 
 
 		 131 aa  203  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  77.59 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  75.86 
 
 		 123 aa  177  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  77.87 
 
 		 134 aa  173  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  73.95 
 
 		 123 aa  173  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  70.94 
 
 		 123 aa  170  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  59.02 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  56.8 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  58.42 
 
 		 203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  48.57 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  50.46 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  50 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  45.95 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  47.27 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  48.65 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  46.36 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  46.36 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  44.55 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  44.55 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  46.96 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  43.64 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  41.96 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  46.36 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  44.55 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  43.64 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  40.18 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  41.24 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  47.47 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  42.86 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  41.07 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  40.18 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  39.29 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  39.29 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  39.29 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  40.37 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  38.39 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  39.29 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  39.29 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  40.18 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  39.33 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  39.77 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  38.32 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  38.2 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>