48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1259 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  100 
 
 		 109 aa  219  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  76.79 
 
 		 116 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  72.17 
 
 		 115 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  72.17 
 
 		 115 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  73.04 
 
 		 115 aa  167  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  73.21 
 
 		 116 aa  167  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  72.17 
 
 		 115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  71.3 
 
 		 115 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  70.43 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  69.57 
 
 		 115 aa  160  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  71.43 
 
 		 160 aa  159  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  70.54 
 
 		 193 aa  157  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  68.97 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  68.75 
 
 		 116 aa  154  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  71.03 
 
 		 116 aa  153  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  67.86 
 
 		 116 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  78.89 
 
 		 116 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  76.67 
 
 		 197 aa  144  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  64.29 
 
 		 116 aa  143  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  52.25 
 
 		 116 aa  105  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  49.55 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  50.45 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  50.45 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  49.55 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  48.25 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  96.7  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  47.79 
 
 		 175 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  51.55 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  47.75 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  46.85 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  49.09 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  46.02 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  42.48 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  42.99 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  38.74 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  42.06 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  38.74 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  40.37 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  41.12 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  43.82 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  45.45 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  38.32 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  40.91 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  39.22 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  37.38 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  37.62 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  35.9 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>