49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2521 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  393  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  68.29 
 
 		 135 aa  165  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  56.59 
 
 		 124 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  56.25 
 
 		 123 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  57.76 
 
 		 123 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  55.91 
 
 		 123 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  53.17 
 
 		 131 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  58.42 
 
 		 131 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  54.33 
 
 		 123 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  55.47 
 
 		 134 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  48.78 
 
 		 118 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  53.04 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  49.59 
 
 		 132 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  52.38 
 
 		 121 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  46.22 
 
 		 115 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  49.14 
 
 		 116 aa  91.3  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  47.9 
 
 		 116 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  43.66 
 
 		 175 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  50.86 
 
 		 113 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  53.93 
 
 		 116 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  53.93 
 
 		 116 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  55.68 
 
 		 116 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  52.81 
 
 		 116 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  56.32 
 
 		 116 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  55.06 
 
 		 116 aa  85.1  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  52.81 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  48.57 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  46.96 
 
 		 160 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  46.96 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  41.53 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  47.73 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  43.48 
 
 		 118 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  44.32 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  45.98 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  34.71 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  44.32 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  41.41 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  41.41 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  41.94 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  40.17 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  41.18 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  41.51 
 
 		 116 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  42.61 
 
 		 116 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 116 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  43.68 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 109 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  38.64 
 
 		 1716 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>