50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3668 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  239  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  61.74 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  63.64 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  62.16 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  62.5 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  62.5 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  61.61 
 
 		 116 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  61.4 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  62.16 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  58.56 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  59.82 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  57.66 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  56.64 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  60 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  49.14 
 
 		 115 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  50.45 
 
 		 116 aa  110  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  49.11 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  51.3 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  48.28 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  49.11 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  49.11 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  46.43 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  46.43 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  49.55 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  45.54 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  48.18 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  56.67 
 
 		 203 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  47.27 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  48.08 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  46.61 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  46.43 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  45.54 
 
 		 193 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  50.56 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  50.56 
 
 		 197 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  45.95 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  48.21 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  44.55 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  47.32 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  45.54 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  46.85 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  44.12 
 
 		 134 aa  84.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  41.96 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  41.07 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  46.67 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  53.85 
 
 		 97 aa  67  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4449  hypothetical protein  45.61 
 
 		 266 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000448491 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4214  hypothetical protein  40 
 
 		 340 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>