48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0162 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  89.09 
 
 		 132 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  56.57 
 
 		 123 aa  110  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  53.27 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  54.55 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  48.57 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  54.55 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  53.15 
 
 		 175 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  51.35 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  50.89 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  51.35 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  45.69 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  46.67 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  54.35 
 
 		 203 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  48.65 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  49.56 
 
 		 115 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  48.67 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  48.65 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  48.65 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  47.75 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  46.85 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  48.21 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  47.37 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  39.66 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  41.23 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  50.49 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  39.82 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  38.26 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  39.13 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  38.26 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  38.26 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  36.52 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  36.52 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  40.78 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  43.24 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  42.34 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  38.1 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  40.54 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  42.34 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  38.74 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  38.2 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  39.33 
 
 		 197 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  38.05 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  36.52 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  34.33 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>