50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2608 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  235  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  235  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  99.14 
 
 		 116 aa  234  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  90.52 
 
 		 116 aa  218  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  90.43 
 
 		 116 aa  216  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  90.52 
 
 		 116 aa  215  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  89.66 
 
 		 116 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  87.07 
 
 		 175 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  85.22 
 
 		 116 aa  201  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  72.97 
 
 		 113 aa  164  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  63.48 
 
 		 116 aa  153  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  62.5 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  57.89 
 
 		 115 aa  127  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  55.17 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  67.35 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  53.04 
 
 		 116 aa  116  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  48.7 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  51.3 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  52.17 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  52.73 
 
 		 113 aa  106  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  50.43 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  50 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  50.88 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  50.88 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  48.7 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  49.54 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  49.57 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  49.57 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  50.45 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  48.65 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  49.12 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  49.12 
 
 		 193 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  47.83 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  47.37 
 
 		 116 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  46.96 
 
 		 197 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  48.65 
 
 		 121 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  53.93 
 
 		 203 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  45.71 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  43.97 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  47.12 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  44.55 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  42.73 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  43 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  42.73 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  41.28 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  48.44 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4449  hypothetical protein  47.37 
 
 		 266 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000448491 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  34.67 
 
 		 1716 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>