48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3529 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  100 
 
 		 116 aa  233  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  84.82 
 
 		 115 aa  193  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  79.46 
 
 		 115 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  79.46 
 
 		 115 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  77.68 
 
 		 115 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  75.89 
 
 		 115 aa  176  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  75.89 
 
 		 115 aa  174  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  75.22 
 
 		 160 aa  174  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  74.34 
 
 		 118 aa  173  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  72.41 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  73.21 
 
 		 109 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  72.41 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  68.1 
 
 		 116 aa  159  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  74.14 
 
 		 116 aa  157  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  66.38 
 
 		 116 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  67.24 
 
 		 193 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  63.79 
 
 		 116 aa  154  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  74.14 
 
 		 197 aa  154  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  65.52 
 
 		 116 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  53.04 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  53.04 
 
 		 116 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  53.04 
 
 		 116 aa  116  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  52.17 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  50.45 
 
 		 118 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  50.43 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  48.7 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  50.43 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  57.14 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  48.7 
 
 		 116 aa  104  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  50 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  50.88 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  50.45 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  46.02 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  44.55 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  41.23 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  39.47 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  41.96 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  44.32 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  42.73 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  47.19 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  42.73 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  42 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  38.18 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  40.38 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  37.27 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  40.79 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>